Біохімія рослин

Фотосинтез: C₃, C₄ і CAM

Як рослина перетворює світло, воду й CO₂ на цукри: цикл Кальвіна, фотодихання, C₄-фотосинтез і CAM-метаболізм — зі стислою теорією, покроковими візуалізаціями того, що й де відбувається в клітині, моделлю газообміну листка та прикладами рослин.

Цикл КальвінаФотодиханняC₄ · кранц-анатоміяCAMМодель FvCB

01Загальна картина

Фотосинтез — процес, у якому рослина за рахунок енергії світла перетворює вуглекислий газ і воду на органічні речовини та виділяє кисень. Це єдине джерело органічної речовини й кисню на планеті: за рік рослини суші й океану фіксують близько 120 млрд т вуглецю.

6CO2+12H2O⟶світло,хлорофілC6H12O6+6O2+6H2O

Увесь процес відбувається в хлоропласті і складається з двох зв'язаних етапів. Світлові реакції йдуть на мембранах тилакоїдів: пігменти поглинають світло, вода розщеплюється з виділенням O₂, а енергія електронів запасається в ATP і відновнику NADPH. Темнові (карбонові) реакції йдуть у стромі: за рахунок ATP і NADPH вуглекислий газ відновлюється до цукрів у циклі Кальвіна. Назва «темнові» умовна: ферменти циклу активуються саме на світлі.

ЦиклКальвінаCO₂ з повітрятріозофосфати →сахароза, крохмальO₂ ↑фотоліз: 2H₂O → 4H⁺ + 4e⁻ + O₂Тилакоїди, зібрані в грани:світлові реакції, ФС II → b₆f → ФС I,АТФ-синтаза → ATP і NADPHСтрома:ферменти циклу Кальвіна, РубіскоПодвійна мембрана:зовнішня та внутрішнякрохмальне зерно
Хлоропласт: тилакоїди зібрані в грани (світлові реакції), строма містить ферменти циклу Кальвіна. Жовті й сині частинки — потоки ATP і NADPH від гран до циклу та повернення ADP і NADP⁺.
Чому шляхів три?

Ключовий фермент фіксації CO₂ — Рубіско — з'явився в бескисневій атмосфері й плутає CO₂ з O₂. У сучасному повітрі (21 % O₂ проти 0,042 % CO₂) це спричиняє втратне фотодихання. C₄- і CAM-рослини навчилися концентрувати CO₂ біля Рубіско.

C₃

Без концентрування CO₂: Рубіско працює з CO₂, що дифундує з повітря. ≈ 85 % видів рослин.

C₄

Просторове розділення: мезофіл накачує CO₂ у клітини обкладки пучка. ≈ 3 % видів, але чверть світової первинної продукції.

CAM

Часове розділення: уночі CO₂ запасається у вакуолі як малат, удень — повертається в цикл Кальвіна. ≈ 6 % видів.

02C₃-фотосинтез: цикл Кальвіна

Цикл Кальвіна — Бенсона — Басхема відбувається в стромі хлоропластів. Назва «C₃-шлях» походить від першого стабільного продукту — тривуглецевої 3-фосфогліцеринової кислоти (3-ФГК). Щоб на виході отримати одну молекулу тріозофосфату (3 атоми C), цикл має зробити три оберти, тобто зафіксувати 3 CO₂. Цикл має три фази.

  1. Карбоксилювання. Рубіско приєднує CO₂ до п'ятивуглецевого акцептора рибулозо-1,5-бісфосфату (RuBP). Нестійкий C₆-інтермедіат одразу розпадається на дві молекули 3-ФГК. Реакція практично необоротна (ΔG°′ ≈ −35 кДж/моль).
  2. Відновлення. 3-ФГК фосфорилюється ATP до 1,3-бісфосфогліцерату, який NADPH відновлює до гліцеральдегід-3-фосфату (Г3Ф) — тріозофосфату, первинного цукру фотосинтезу. Саме тут витрачається вся «світлова» енергія NADPH.
  3. Регенерація RuBP. З шести утворених тріозофосфатів один виходить із циклу (на синтез сахарози в цитозолі чи крохмалю в хлоропласті), а п'ять (15 атомів C) через низку перетворень (альдолаза, транскетолаза, фосфатази) дають три п'ятивуглецеві молекули, які фосфорибулокіназа за рахунок ATP перетворює на RuBP.
3CO2+9ATP+6NADPH⟶1Г3Ф+9ADP+8Pi+6NADP+(1)

На одну молекулу глюкози (6 обертів) — 6 CO₂, 18 ATP і 12 NADPH; на кожен CO₂ — 3 ATP і 2 NADPH.

Рубіско — найпоширеніший білок Землі. Фермент складається з 8 великих (ген rbcL у ДНК хлоропласту) і 8 малих субодиниць (гени RBCS у ядрі). Він дуже повільний — лише 3–4 акти каталізу за секунду, — тому займає 30–50 % розчинного білка листка.

Світлова регуляція. Щоб цикл не «спалював» ATP у темряві, його ключові ферменти вмикаються лише на світлі: тіоредоксин, відновлений фередоксином від ФС I, активує ГАФДГ, ФБФазу, СБФазу та ФРК; Рубіско активується Рубіско-активазою, карбамілюванням лізину-201 і зростанням pH строми до 8 та концентрації Mg²⁺.

КАРБОКСИЛЮВАННЯВІДНОВЛЕННЯРЕГЕНЕРАЦІЯ RUBPРубіскоФГК-кіназаНАДФ-ГАФДГальдолаза, транскетолаза,ФРК (фосфорибулокіназа)ФБФаза, СБФаза3 CO₂6 ATP6 ADP6 NADPH6 NADP⁺ + Pᵢ3 ATP3 ADP1 Г3Ф (нетто)→ сахароза, крохмаль3 × RuBPрибулозо-1,5-бісфосфат6 × 3-ФГК3-фосфогліцерат6 × 1,3-БФГК1,3-бісфосфогліцерат6 × Г3Фгліцеральдегід-3-фосфат3 × Ru5Pрибулозо-5-фосфатза 3 оберти циклу0CO₂ зафіксовано0ATP витрачено0NADPH витраченоатомів C у циклі:15

03Фотодихання

Активний центр Рубіско приєднує не лише CO₂, а й O₂. Співвідношення швидкостей карбоксилювання (vc) та оксигенування (vo) залежить від специфічності ферменту Sc/o ≈ 80–100 і концентрацій газів біля нього:

vcvo=Sc/o·[CO2][O2](2)

Навіть за 25 °C кожне четверте-п'яте спрацьовування Рубіско — «помилкове». Оксигенування дає одну молекулу 3-ФГК та двовуглецевий 2-фосфогліколат, який отруює ферменти хлоропласту. Його переробляє гліколатний шлях (цикл C₂), що охоплює три органели: з двох молекул 2-фосфогліколату (4 атоми C) повертається одна 3-ФГК (3 C), а один атом вуглецю втрачається як CO₂. Крім того, виділяється NH₃, який треба знову зв'язати.

Фотодихання різко зростає в спеку й посуху: розчинність CO₂ з нагріванням падає швидше, ніж розчинність O₂; специфічність Рубіско знижується; продихи закриваються, і CO₂ у листку вичерпується. На одне оксигенування рослина витрачає 3,5 ATP і 2 NADPH, нічого не отримуючи. Утім, фотодихання не марне: воно скидає надлишок енергії світла, коли продихи закриті (захист від фотоінгібування), і постачає гліцин і серин.

Клітина мезофілу листка (цитозоль)ХлоропластЦиклКальвінаРубіскоGS / GOGATGLYKПероксисомаGOX · каталазаМітохондріяGDC · SHMTO₂CO₂ ↑

Умови для листка C₃-рослини

карбоксилювання (vc)оксигенування (vo)
Γ* (компенсаційний пункт фотодихання)
—
vo / vc
—
Втрата щойно фіксованого C
—
Додаткові витрати на 100 CO₂
—

04C₄-фотосинтез (цикл Хетча — Слека)

C₄-фотосинтез незалежно виник понад 60 разів як пристосування до спеки, яскравого світла й посухи. Перший продукт фіксації — чотиривуглецева щавлевооцтова кислота (оксалоацетат), яка швидко перетворюється на малат чи аспартат. Майже всі C₄-рослини мають кранц-анатомію (нім. Kranz — вінок): провідний пучок оточений щільним шаром великих клітин обкладки, а навколо нього — кільце клітин мезофілу.

  • Мезофіл контактує з міжклітинниками, але не має Рубіско. Тут карбоангідраза перетворює CO₂ на HCO₃⁻, а ФЕП-карбоксилаза приєднує його до фосфоенолпірувату (ФЕП). Цей фермент має високу спорідненість до субстрату й зовсім не реагує з O₂.
  • Обкладка пучка містить усю Рубіско і ферменти циклу Кальвіна. C₄-кислота надходить сюди через плазмодесми й декарбоксилюється: концентрація CO₂ сягає 1000–2000 ppm (у 10–20 разів більше, ніж у листку C₃-рослини), і фотодихання майже зникає.
  • Тривуглецевий залишок повертається в мезофіл, де піруват-ортофосфатдикіназа (ППДК) регенерує ФЕП. Це коштує 2 ATP на кожен CO₂, тож C₄-шлях потребує 5 ATP і 2 NADPH на CO₂ замість 3 і 2 у C₃.
ксилемафлоемаКранц-анатомія«вінок» клітин обкладки навколо пучкамезофілобкладка пучкаКлітина мезофілуКлітина обкладкиплазмодесмиКАФЕП-КНАДФ-МДГППДКНАДФ-МЕРубіско · КальвінCO₂
ПідтипДекарбоксилаза в обкладціКислота M → ОПовертається О → MХлоропласти обкладкиПриклади
НАДФ-МЕНАДФ-малік-ензим, хлоропластмалатпіруватагранальні (майже без ФС II), суберинова пластинкакукурудза, цукрова тростина, сорго, мишій
НАД-МЕНАД-малік-ензим, мітохондріяаспартаталанінгранальніпросо, щириця (амарант), портулак, лобода
ФЕП-ККФЕП-карбоксикіназа, цитозоль (+ НАД-МЕ)аспартат, малатФЕП, аланінгранальні, суберинова пластинкагвінейська трава, хлоріс, спартина

05CAM-метаболізм

CAM (Crassulacean Acid Metabolism, метаболізм за типом товстянкових) уперше виявили в каланхое й товстянки, де вміст кислот і pH клітинного соку коливаються протягом доби. У CAM-рослин обидва карбоксилювання — ФЕП-карбоксилазою і Рубіско — відбуваються в одній клітині, але в різний час. Продихи відкриваються вночі, коли прохолодно й волого, і закриті в спекотний день: CAM-рослини витрачають на 1 г сухої речовини лише 20–100 г води (C₃ — 400–900 г).

  1. Фаза I — ніч. Продихи відкриті. Крохмаль розщеплюється в гліколізі до ФЕП, ФЕП-карбоксилаза фіксує CO₂, оксалоацетат відновлюється до малату. Малат закачується у велику центральну вакуолю, де перетворюється на яблучну кислоту; pH клітинного соку падає з ≈ 6 до 3–3,5.
  2. Фаза II — світанок. Продихи ще 1–2 години відкриті; деякий час одночасно працюють ФЕП-карбоксилаза і Рубіско.
  3. Фаза III — день. Продихи щільно закриті. Яблучна кислота виходить з вакуолі й декарбоксилюється; CO₂ у клітині сягає 3000–10 000 ppm, і Рубіско працює майже без фотодихання. Піруват через глюконеогенез повертається в крохмаль — запас ФЕП на наступну ніч.
  4. Фаза IV — вечір. Коли малат вичерпано, а води достатньо, продихи знову відкриваються, і рослина фіксує CO₂ напряму, як C₃. У посуху фази II і IV випадають, а за тривалої посухи настає CAM на холостому ходу: продихи закриті цілодобово, рослина лише переробляє власний «дихальний» CO₂.
00:0003:0006:0009:0012:0015:0018:0021:0024:00епідермапродихЦентральна вакуоляpH 6,0ФЕП-Кмалік-ензимгліколізФАЗА ЗА ОСМУНДОМIНічПРОДИХИвідкритіМАЛАТ У ВАКУОЛІ—КРОХМАЛЬПОГЛИНАННЯ CO₂ ЛИСТКОМ—CO₂ У КЛІТИНІ—
00:00

Добовий хід: поглинання CO₂ листком, малат у вакуолі та провідність продихів

06Модель: C₃ проти C₄

Як швидкість фотосинтезу залежить від CO₂, світла й температури, описує біохімічна модель Фаркуара — фон Каммерер — Беррі (FvCB). Чистий фотосинтез листка C₃ обмежує найповільніший із процесів: активність Рубіско (Wc), регенерація RuBP за рахунок електронного транспорту (Wj) або використання тріозофосфатів (Wp):

Anet=min(Vc,max(Ci−Γ*)Ci+Kc(1+O/Ko),J(Ci−Γ*)4Ci+8Γ*,3Tp)−Rd(3)

Γ* — компенсаційний пункт фотодихання (≈ 43 ppm при 25 °C); Kc, Ko — константи Міхаеліса Рубіско для CO₂ і O₂; J — швидкість електронного транспорту, що залежить від освітленості; Rd — мітохондріальне дихання. Усі константи змінюються з температурою за рівнянням Арреніуса: Kc зростає швидше, ніж Ko, тож у спеку фотодихання стрімко посилюється. Для C₄ використано двокомпартментну модель фон Каммерер: ФЕП-карбоксилаза мезофілу (Vp) накачує CO₂ в обкладку, де працює Рубіско.

Вісь графіка

Умови

A, C₃ (пшениця)
—
A, C₄ (кукурудза)
—
Обмежує C₃
—
Фотодихання C₃
—
CO₂ в обкладці C₄
—

07Порівняння та приклади рослин

ОзнакаC₃C₄CAM
Перший карбоксилюючий ферментРубіскоФЕП-карбоксилазауночі ФЕП-карбоксилаза, удень Рубіско
Перший стабільний продукт3-ФГК (C₃)оксалоацетат (C₄) → малат / аспартатуночі малат у вакуолі, удень 3-ФГК
Розділення фіксаційнемаєпросторове: мезофіл → обкладкачасове: ніч → день
Анатомія листкапалісадний і губчастий мезофілкранц-анатоміясукулентний мезофіл з великими вакуолями
Енергія на 1 CO₂3 ATP + 2 NADPH5 ATP + 2 NADPH5,5–6,5 ATP + 2 NADPH
Фотодиханнявисоке: 20–40 % при 25–35 °C< 2–5 %дуже низьке у фазі III
CO₂-компенсаційний пункт40–60 ppm, росте з температурою0–5 ppm0–5 ppm уночі
Температурний оптимум15–25 °C30–45 °Cудень 30–35 °C, уночі 10–20 °C
Насичення світломпри 500–1000 мкмоль·м⁻²·с⁻¹не насичується навіть на повному сонціпомірне
Води на 1 г сухої речовини400–900 г250–350 г20–100 г
Макс. швидкість фотосинтезу15–35 мкмоль CO₂·м⁻²·с⁻¹35–651–10
δ¹³C біомасивід −24 до −34 ‰від −10 до −16 ‰від −10 до −20 ‰

C₃-рослини

Помірний клімат, достатня волога; ≈ 85 % видів.

  • Пшениця Triticum aestivumголовна зернова культура України
  • Рис Oryza sativaгодує половину людства
  • Соя, горох, квасоля Glycine max, Pisum sativum, Phaseolus vulgarisбобові
  • Соняшник Helianthus annuusолійна культура
  • Цукровий буряк, картопля Beta vulgaris, Solanum tuberosum
  • Дерева Quercus, Fagus, Pinus, Betulaусі лісові породи

C₄-рослини

Спека, яскраве світло, посуха; переважно злаки тропічного походження.

  • Кукурудза Zea maysНАДФ-МЕ; рекордна продуктивність
  • Цукрова тростина Saccharum officinarumНАДФ-МЕ
  • Сорго Sorghum bicolorпосухостійка культура
  • Просо Panicum miliaceumНАД-МЕ
  • Щириця Amaranthus retroflexusНАД-МЕ; злісний бур'ян
  • Мишій, плоскуха Setaria viridis, Echinochloa crus-galliбур'яни посівів

CAM-рослини

Пустелі, скелі, крони дерев (епіфіти); ≈ 6 % видів.

  • Ананас Ananas comosusголовна CAM-культура
  • Агава Agave tequilanaсировина для текіли
  • Опунція, кактуси Opuntia ficus-indica, Cactaceae
  • Каланхое, товстянка Kalanchoe, Crassula ovataродина товстянкових — звідси назва
  • Орхідеї, ваніль Phalaenopsis, Vanilla planifoliaепіфіти
  • Кришталева трава Mesembryanthemum crystallinumперемикається C₃ ↔ CAM під час посухи

08Контрольні питання

Чому для синтезу однієї молекули тріозофосфату потрібно три оберти циклу Кальвіна?
За один оберт фіксується одна молекула CO₂ (1 атом C). Тріозофосфат містить 3 атоми C, тому треба зафіксувати 3 CO₂; решта 15 атомів C із шести тріозофосфатів ідуть на регенерацію трьох молекул RuBP.
Скільки ATP і NADPH потрібно на одну молекулу глюкози в C₃- і C₄-рослин?
C₃: 18 ATP і 12 NADPH (3 і 2 на кожен CO₂). C₄: 30 ATP і 12 NADPH, бо регенерація ФЕП ферментом ППДК коштує ще 2 ATP на CO₂.
Чому фотодихання посилюється в спеку і посуху?
Розчинність CO₂ з нагріванням падає швидше, ніж O₂; специфічність Рубіско до CO₂ знижується (Kc зростає швидше, ніж Ko); продихи закриваються, і концентрація CO₂ у листку падає. Усе це збільшує частку оксигенування.
У яких органелах відбувається фотодихання і де втрачається CO₂?
Хлоропласт (оксигенування RuBP, утворення гліколату) → пероксисома (гліколат → гліоксилат → гліцин) → мітохондрія (2 гліцин → серин + CO₂ + NH₃) → пероксисома (серин → гліцерат) → хлоропласт (гліцерат → 3-ФГК). CO₂ виділяється в мітохондрії під час декарбоксилювання гліцину.
Навіщо C₄-рослинам кранц-анатомія?
Вона просторово розділяє первинну фіксацію (ФЕП-карбоксилаза в мезофілі) і цикл Кальвіна (Рубіско в обкладці). Щільна стінка обкладки, часто з субериновою пластинкою, не випускає накачаний CO₂ назад, тому біля Рубіско його концентрація в 10–20 разів вища, ніж у повітрі, і фотодихання майже не відбувається.
Чим відрізняються підтипи НАДФ-МЕ і НАД-МЕ?
У НАДФ-МЕ (кукурудза) з мезофілу в обкладку переноситься малат, який декарбоксилюється в хлоропласті з утворенням NADPH, а назад повертається піруват; хлоропласти обкладки агранальні. У НАД-МЕ (просо, щириця) переноситься аспартат, декарбоксилювання відбувається в мітохондріях, повертається аланін.
Чому pH клітинного соку CAM-рослин уранці нижчий, ніж увечері?
Уночі фіксований CO₂ запасається у вакуолі у вигляді яблучної кислоти, і pH знижується до 3–3,5. Удень кислота виходить із вакуолі й декарбоксилюється, тому до вечора pH повертається до ≈ 6.
Чому кукурудза, сорго й щириця добре почуваються в спекотне літо, а пшениця — ні?
Це C₄-рослини: у них майже немає фотодихання, температурний оптимум 30–45 °C, вони ефективніше використовують воду й азот. У C₃-пшениці за 30 °C і вище фотодихання забирає до третини фіксованого вуглецю, а продихи доводиться прикривати.

09Література

  1. Макрушин М. М., Макрушина Є. М., Петерсон Н. В., Мельников М. М. Фізіологія рослин : підручник. — Вінниця : Нова Книга, 2006. — 416 с.
  2. Taiz L., Zeiger E., Møller I. M., Murphy A. Plant Physiology and Development. — 6th ed. — Sinauer, 2015. — Ch. 8: Photosynthesis: the carbon reactions.
  3. Berg J. M., Tymoczko J. L., Stryer L. Biochemistry. — 5th ed. — W. H. Freeman, 2002. — Section 20.1: The Calvin cycle.
  4. Farquhar G. D., von Caemmerer S., Berry J. A. A biochemical model of photosynthetic CO₂ assimilation in leaves of C₃ species // Planta. — 1980. — Vol. 149. — P. 78–90.
  5. von Caemmerer S. Biochemical Models of Leaf Photosynthesis. — CSIRO Publishing, 2000.
  6. Peterhansel C. et al. Photorespiration // The Arabidopsis Book. — 2010. — Vol. 8. — e0130.
  7. Rao X., Dixon R. A. The differences between NAD-ME and NADP-ME subtypes of C₄ photosynthesis // Frontiers in Plant Science. — 2016. — Vol. 7. — 1525.
  8. Osmond C. B. Crassulacean acid metabolism: a curiosity in context // Annual Review of Plant Physiology. — 1978. — Vol. 29. — P. 379–414.
  9. Моргун В. В. та ін. Фотосинтез і продуктивність: основні наукові досягнення та інноваційні розробки // Фізіологія рослин і генетика. — 2021. — Т. 53, № 2.