Усі розділи КонспектуКонспект · фізіологія і біофізика рослин

Транспорт іонів у клітинах рослин

Конспект у 9 розділах: як мембрана стає батареєю, як вимірюють струми через один канал, хто переносить K⁺, Na⁺, Ca²⁺, аніони, нітрат і фосфат — і як ці білки керують ростом, продихами, сигналами та стійкістю до стресів.

9 розділів40 підрозділівІнтерактивні моделіРозбори статей

Огляд теми

Конспект зібрано на основі наукових статей і оглядів: від біофізики мембрани й методів реєстрації струмів до родин каналів, транспортерів і помп калію, натрію, кальцію, аніонів, нітрату й фосфату — з розборами ключових експериментальних робіт. Оберіть розділ або скористайтеся картою клітини нижче.

Канал — пасивно, 10⁶–10⁸ іонів/сТранспортер — уніпорт, симпорт, антипортПомпа (АТФаза) — первинно-активно

Карта транспортних систем клітини

Понад 30 білків, про які йдеться в конспекті, на своїх мембранах. Відфільтруйте за іоном чи типом і натисніть на білок — з картки можна перейти до розділу.

Інтерактивна картаРослинна клітина: хто що переносить
Карта транспортних систем рослинної клітиниАпопласт · клітинна стінкаЦитозоль · pH 7,2–7,5 · Ca²⁺ ~100 нМВакуоляpH 5–5,5 · Ca²⁺ 1–5 мМХлоропластЯдроМітохондріяЕРATPAHA2AKT1 + AtKC1HAK5GORKSOS1HKT1;1NRT1.1NRT2.1CNGC14 / 18GLR3.3 / 3.6MCA · OSCA · MSL · PIEZOSLAC1ALMT12 (QUAC1)ALMT1PHT1;1 / 1;4ATPACA8 / 9KAT1 / KAT2ATPV-АТФазаATPV-PPaseTPK1TPC1 (SV)AtClC-aALMT9CAXPHT5 (VPT1)NHXKEA1 / 2PHT2MSL2 / 3TPK3KEA3KUP9PHT3MSL1
Розділ 1

Проникність плазмалеми, електрохімічний потенціал та основи електрофізіології

H⁺-АТФаза · KcsA · рівняння Нернста · patch clamp

1.1Бар'єр ліпідного бішару

Плазмалему утворює подвійний шар фосфоліпідів: гідрофільні головки дивляться у воду (цитозоль і апопласт), гідрофобні хвости утворюють неполярне ядро завтовшки кілька нанометрів. Тому чистий бішар пропускає речовини дуже вибірково:

Апопласт (водна фаза)Цитозоль (водна фаза)ліпідний бішар ≈ 5 нмГідрофобні молекулиO₂ · CO₂ · N₂проходять вільноМалі полярніH₂O · сечовинаповільно (+ аквапорини)Великі полярніглюкоза · сахарозамайже не проходятьІони з гідратною оболонкоюK⁺ · Na⁺ · Cl⁻ · H⁺K⁺не проходять — потрібні білки
Чотири класи речовин і ліпідний бішар. Іон «одягнений» у гідратну оболонку: щоб увійти в гідрофобне ядро, йому довелося б скинути воду, а це енергетично нездоланний бар'єр.

Отже, бішар — це електричний ізолятор між двома провідниками (розчинами з рухливими іонами). Єдині «шлюзи» для іонів — інтегральні білки: канали, транспортери (переносники) та помпи (АТФази). Саме їхня регуляція задає іонний склад цитозолю, тургор і pH, від яких залежать конформація білків і робота нуклеїнових кислот.

Усі іонні канали — від бактерій до людини — мають трансмембранний домен, що утворює пору, і регуляторні домени з сайтами для агоністів, блокаторів, алостеричних модуляторів і протеїнкіназ (класичний приклад багатосайтової регуляції — нікотиновий ацетилхоліновий рецептор).

1.2Мембранний потенціал: рослини проти тварин

Мембранний потенціал — різниця електричних потенціалів між внутрішньою і зовнішньою поверхнями мембрани. Потенціал зовнішнього розчину приймають за нуль:

Vm=Ψin−Ψout,Ψout=0(1.1)

Для потенціалу не потрібна макроскопічна зміна концентрацій — досить мікроскопічного надлишку нескомпенсованих зарядів уздовж поверхонь «ліпідного конденсатора». Жива клітина завжди заряджена мінусом усередині; потенціал 0 мВ — ознака мертвої клітини.

ОзнакаТваринна клітинаРослинна клітина
Первинна помпа плазмалемиNa⁺/K⁺-АТФаза (3Na⁺ назовні / 2K⁺ всередину)H⁺-АТФаза P-типу — викачує H⁺ в апопласт
Помпи тонопласталізосомальна V-АТФазаV-АТФаза і H⁺-пірофосфатаза (V-PPase)
Градієнт pH на плазмалемімалий (7,2 / 7,4)виражений: цитозоль 7,2–7,5, апопласт і вакуоля 5,0–5,5
Потенціал спокою−60…−90 мВ−70…−200 мВ (часто −120…−180)
«Валюта» вторинного транспортуградієнт Na⁺протонно-рушійна сила (ΔpH + Vm)
Клітини червоної цибулі під мікроскопом
Клітини червоної цибулі: забарвлена антоціанами вакуоля займає майже весь об'єм; її тонопласт несе V-АТФазу і V-PPase.User:TheGroninger · CC BY-SA 4.0
Модель ліпідного бішару між розчинами солей
Молекулярна динаміка: ліпідні бішари розділяють розчини NaCl і KCl — іони не входять у гідрофобне ядро.sobolevnrm · CC BY-SA 2.0

Струм іонів через мембрану підкоряється закону Ома: I = ΔV / R = g · ΔV, де провідність g = 1/R (у сименсах) пропорційна кількості відкритих каналів.

1.3Електрохімічний градієнт і рівняння Нернста

Уявімо посудину з мембраною. Якщо в мембрані є пори для сахарози, вона дифундує, доки концентрації не зрівняються. А якщо внести KCl, а канали пропускають лише K⁺? Калій піде за хімічним градієнтом, хлорид залишиться — лівий відсік зарядиться негативно, правий позитивно, і електричне поле почне тягнути K⁺ назад. Настане рівновага двох сил.

Головне. напрямок і швидкість руху іона визначає електрохімічний градієнт — сума хімічного (концентраційного) градієнта та електричного поля мембрани.

Потенціал реверсії (рівноважний, нернстівський) Ei — потенціал, за якого електрична сила точно врівноважує дифузійну, і результуючий потік іона дорівнює нулю. Іони й далі проходять відкритими каналами в обидва боки, але входжень стільки ж, скільки виходжень. Ei залежить лише від співвідношення концентрацій, заряду іона і температури — і не залежить від кількості відкритих каналів.

Ei=RTzFln⁡[C]out[C]in(1.2)

Формула (1.3) — для 21 °C. R = 8,314 Дж/(моль·К); T — температура, К; z — заряд іона зі знаком (+1 для K⁺ і Na⁺, +2 для Ca²⁺, −1 для Cl⁻ і NO₃⁻); F = 96 485 Кл/моль.

Ei≈61 мВzlog10⁡[C]out[C]in(1.3)
Приклад 1. Натрій

[Na⁺]in = 14 мМ, [Na⁺]out = 140 мМ → ENa = 61 · lg 10 = +61 мВ. При Vm від −70 до −200 мВ і хімічний, і електричний градієнти женуть Na⁺ всередину — тому клітина обмежує проникність для Na⁺ і викачує його (SOS1 назовні, NHX у вакуолю).

Приклад 2. Калій

[K⁺]in = 140 мМ, [K⁺]out = 4 мМ → EK = −61 · lg 35 ≈ −94 мВ, близько до потенціалу спокою. Рибосоми та ферменти потребують 100–200 мМ K⁺, і негативний потенціал утримує калій усередині майже рівноважно.

Інтерактивна модельКалькулятор Нернста і баланс сил

Оберіть іон, змініть концентрації та потенціал мембрани. Стрілки показують хімічну й електричну силу, а висновок — куди піде іон пасивно.

Сумарний струм іона визначають провідність мембрани для нього і електрохімічна рушійна сила (Vm − Ei):

Ii=gi·(Vm−Ei),gi=N·Popen·γ(1.4)

Якщо Vm = Ei, струму немає навіть за повністю відкритих каналів.

1.4Канали, транспортери, помпи

Транспорт поділяють за термодинамікою (пасивний — за електрохімічним градієнтом; активний — проти нього, за рахунок АТФ або градієнта іншого іона) і за механізмом білка:

Іонні канали

Наскрізна водна пора, лише два стани — відкритий і закритий. 10⁶–10⁸ іонів/с — у ~10⁵ разів швидше за транспортери. Тільки пасивний транспорт, без насичення.

Транспортери (переносники)

Сайт зв'язування і конформаційний цикл «почергового доступу» (alternating access). Лише 10¹–10³ молекул/с, кінетика Міхаеліса–Ментен з плато Vmax.

Помпи (АТФази)

Первинно-активний транспорт: енергія гідролізу АТФ змінює конформацію і спорідненість сайтів, проганяючи іон проти градієнта.

Інтерактивна модельКанал проти транспортера: кінетика

Потік крізь канал зростає лінійно з концентрацією, а транспортер насичується, коли всі молекули переносника зайняті.

За стехіометрією транспортери бувають трьох типів:

АнімаціяУніпорт, симпорт, антипорт

Натисніть на схему, щоб зупинити або запустити анімацію.

Активний транспорт на прикладі конформаційних циклів

  1. Вторинно-активний: H⁺/лактозний симпортерЗовні багато H⁺. Протон зв'язується з Glu транспортера → утворюється високоафінний сайт для лактози → білок повертається в цитозоль, де спорідненість падає: лактоза виходить проти свого градієнта, слідом — H⁺. Жоден субстрат не переноситься без іншого.
  2. Первинно-активний: Ca²⁺-АТФаза P-типуСтан E₁: високоафінні сайти Ca²⁺ дивляться в цитозоль. Зв'язування Ca²⁺ і АТФ, гідроліз, фосфорилювання аспартату → стан E₂-P: пора відкрита назовні, спорідненість падає, Ca²⁺ виходить проти 10 000-кратного градієнта. Відщеплення Pᵢ повертає E₁.

1.5Селективний фільтр KcsA

Як калієвий канал пропускає K⁺ (радіус ≈ 1,33 Å) майже зі швидкістю вільної дифузії, але блокує менший Na⁺ (≈ 0,95 Å) з селективністю понад 1000 : 1? Відповідь дала кристалічна структура бактеріального каналу KcsA зі Streptomyces lividans (Doyle et al., 1998; Нобелівська премія Р. МакКіннона 2003 р.).

  • Консервативний мотив у P-петлі всіх K⁺-каналів — від бактерій і Arabidopsis до людини: T-V-G-Y-G (або споріднений GYGD).
  • «Молекулярна рукавичка»: карбонільні кисні остова TVGYG усіх чотирьох субодиниць дивляться в пору і замінюють іону молекули води.
  • Чому не Na⁺: геометрія кисневої «клітки» точно підігнана під дегідратований K⁺. Менший Na⁺ дістає лише 1–2 кисні — втрату гідратної оболонки нічим компенсувати, тож вхід у фільтр невигідний.
СхемаСелективний фільтр KcsA

Перемкніть іон: K⁺ координується вісьмома карбонільними киснями, Na⁺ «бовтається» в порі.

Позаклітинний вестибюльЦентральна порожнина пори (цитозоль)TVGYGTVGYGсубодиниця 1субодиниця 3K⁺K⁺K⁺ точно «сідає» на 8 карбонільних O — енергія дегідратації компенсована
Сигнатура селективного фільтра в різних царствах
KcsA       Streptomyces (бактерія) … T V G Y G D …
KAT1, AKT1 Arabidopsis (рослина)    … T V G Y G D …
Shaker     Drosophila (комаха)     … T V G Y G D …
Kv1.2      людина                  … T V G Y G D …
Портрет Родеріка МакКіннона
Родерік МакКіннон розшифрував структуру KcsA (Нобелівська премія з хімії, 2003).PotassiumChannel · CC BY-SA 3.0

За механізмом «воріт» (gating) канали бувають:

Потенціал-залежні

Відкриваються при де- або гіперполяризації; мають заряджений сегмент S4 — сенсор напруги.

Ліганд-залежні

Відкриваються ліґандом: глутамат, цАМФ/цГМФ, Ca²⁺.

Механочутливі

Відкриваються натягом бішару: тургор, дотик, вітер, гравітація.

1.6Voltage clamp і patch clamp

Струм через мембрану залежить і від провідності g, і від потенціалу Vm — якщо потенціал «плаває», ці ефекти не розділити. Тому вимірюють у режимі фіксації потенціалу.

  1. Voltage clampЕлектрод вимірює Vm; підсилювач порівнює його з командним Vcmd і миттєво інжектує компенсуючий струм, що утримує Vm = Vcmd. Цей струм дорівнює (з протилежним знаком) сумарному іонному струму мембрани.
  2. Patch clamp (Е. Неєр, Б. Сакман)Скляна мікропіпетка з кінчиком 0,1–0,2 мкм, заповнена електролітом з Ag/AgCl-електродом; опір у розчині 10–40 МОм. Піпетки витягують на пулері перед дослідом.
  3. ПротопластиКлітинна стінка не пускає піпетку до плазмалеми, тому її розщеплюють целюлазами й пектиназами в гіперосмотичному середовищі (або виділяють вакуолі для вивчення тонопласта).
  4. Гігаомний контакт (gigaseal)Легке підсмоктування — і між склом та бішаром виникає контакт з опором 1–10 ГОм. Без нього струм одного каналу (кілька пА) «витік» би в щілину й потонув у шумі.
Схема установки patch clamp
Установка patch clamp: інвертований мікроскоп, піпетка на головному каскаді підсилювача, електрод ванночки, перфузія.PeaBrainC · CC BY-SA 4.0
Скляна піпетка біля клітини
Піпетка підходить до клітини перед утворенням гігаомного контакту (диференційний інтерференційний контраст).Kathrin Bonni, Dimitrios Psyrakis & Sodikdjon A. Kodirov derivativ · CC BY-SA 3.0
Рослинні протопласти під мікроскопом
Рослинні протопласти після ферментативного видалення клітинної стінки — саме з ними працюють методом patch clamp.Carin Jarl · CC BY-SA 4.0
Портрет Ервіна Неєра
Ервін Неєр разом із Бертом Сакманом розробив patch clamp (Нобелівська премія, 1991).Molgen · Public domain
СхемаЧотири конфігурації patch clamp

Перемикайте конфігурації: що опиняється під кінчиком піпетки і який бік мембрани дивиться у ванночку.

1 · Cell-attachedрозчин піпеткизаповнює клітину2 · Whole-cellклітинацитоплазматичнийбік → у ванночку3 · Inside-outзовнішній бік →у ванночку4 · Outside-outпроривз (1) відривз (2) відведення

Ємність мембрани і площа протопласта

Еквівалентна схема: опір піпетки Rs, опір контакту Rseal, опір мембрани Rm і ємність мембрани Cm. Бішар — тонкий діелектрик між двома провідниками, тобто плаский конденсатор ≈ 1 мкФ/см². На сходинку потенціалу спершу тече ємнісний струм Ic = Cm·dV/dt; його інтеграл дає площу протопласта і дозволяє нормувати струм у пА/пФ.

Поодинокі канали, макрострум і I–V криві

  • Дискретність: запис одного каналу — прямокутні сходинки між «закрито» і «відкрито»; напіввідкритих станів немає. Кілька каналів у патчі дають кратні сходинки 1i, 2i, 3i (Hedrich & Neher, 1987).
  • Popen: кожен канал відкривається випадково, але сума ~300 записів відтворює макроскопічний струм цілої клітини разом з активацією та інактивацією.
  • Потенціал-залежність струму ≠ потенціал-залежність воріт. Струм будь-якого відкритого каналу залежить від напруги за законом Ома, і I–V крива — пряма через Erev. Потенціал-залежний канал (як KAT1) має ворота, закриті при деполяризації, і нелінійну «випрямляючу» I–V криву.
  • Хвостові струми (tail currents): після повернення потенціалу канали закриваються не миттєво — спадаючий «хвіст» показує кінетику деактивації і дозволяє точно виміряти Erev.
Інтерактивна модельПоодинокі канали → макроскопічний струм

Стохастичні відкривання кількох каналів у патчі та огинаюча 300 записів.

Інтерактивна модельI–V криві та струми при сходинках напруги

Порівняйте лінійний канал, вхідний (KAT1) і вихідний (GORK) випрямлячі. Змініть [K⁺]out — Erev зсувається; змініть «активатор» — змінюється лише нахил.

Як довести, що струм несе конкретний білок

Гетерологічна експресія

кДНК каналу в ооцитах Xenopus laevis або штучних бішарах.

Erev = EНернста

Потенціал реверсії має зсуватися зі зміною концентрації іона так, як передбачає рівняння Нернста.

Фармакологія і мутанти

TEA⁺, Ba²⁺, Cs⁺ для K⁺-каналів; Gd³⁺, La³⁺, верапаміл для Ca²⁺-каналів; 9-AC, NPPB для аніонних. Блокатори «тваринних» каналів у рослин можуть діяти неспецифічно — потрібна перевірка нокаут-мутантами.

Розділ 2

Потенціал-чутливі барвники, генетично кодовані індикатори та транспорт у везикулах

I–V криві · GEVI · di-4-ANEPPS · везикули ISO/RSO

2.1Як читати I–V криві

Почнемо з практикуму: як читати електрофізіологічні графіки в статтях.

Патч чи ціла клітина?

Дивіться на масштабну лінійку: одиниці пА і дискретні сходинки — запис поодиноких каналів; нА (в ооцитах — мкА) і гладкі криві — whole-cell або TEVC.

Контроль в ооцитах

Обов'язково показують ооцит, ін'єктований водою чи порожнім вектором. Активний K⁺-канал ще й зсуває потенціал спокою ооцита до EK.

Вхідний / вихідний випрямляч

Вхідний — струм лише при гіперполяризації (нижче −80…−100 мВ), I < 0. Вихідний — активується деполяризацією, I > 0.

Ліганд-залежний канал

I–V майже лінійна, але нахил різко зростає, коли додати ліганд (наприклад, Ca²⁺ з цитоплазматичного боку).

Механочутливий канал

На записі вказують тиск у піпетці (мм рт. ст.). У дикого типу відкриваються 4–5 каналів, у мутанта msl9;msl10 відповідь зникає.

Головне. якщо [K⁺]out = [K⁺]in, то lg 1 = 0 і EK = 0 мВ. Якщо зовнішній калій зробити набагато вищим за внутрішній, хімічний градієнт жене K⁺ усередину навіть при 0 мВ — щоб зупинити потік, потрібен позитивний потенціал, і Erev зсувається в додатну область. Спробуйте це в моделі I–V вище.

2.2Флуоресценція і мікроскоп

Patch clamp інвазивний: потрібні протопласти, і не видно розподілу потенціалу по живій тканині. Альтернатива — оптичні методи з флуоресцентними зондами.

S₀S₁S₂поглинанняλexколивальна релаксація (тепло)флуоресценціяλem> λexенергія ↑
Діаграма Яблонського. Поглинання фотона переводить електрон з S₀ на S₁/S₂; частина енергії йде на коливальну релаксацію, тож випромінений фотон має меншу енергію: λem > λex (стоксів зсув). GFP: збудження ≈ 488 нм, емісія ≈ 509 нм.
дихроїчнедзеркало 45°збуджуючийфільтремісійний фільтрлампазразок + об'єктивдо камери / окуляра
Куб фільтрів флуоресцентного мікроскопа: збуджуючий фільтр, дихроїчне дзеркало під 45° (відбиває коротку хвилю на об'єкт, пропускає довгу до детектора) і емісійний фільтр. Поріг дзеркала лежить між λex і λem: для EBFP (380/440 нм) — 400–420 нм.
Флуоресцентний мікроскоп
Флуоресцентний мікроскоп з револьвером кубів фільтрів.Masur · CC BY-SA 3.0
Медуза Aequorea victoria
Медуза Aequorea victoria — джерело GFP і кальцієвого фотобілка екворину.Ssblakely · CC BY (атрибуція)
Структура зеленого флуоресцентного білка
GFP: хромофор захований усередині β-бочки з 11 тяжів.Erin Rod · CC BY-SA 4.0

2.3Генетично кодовані індикатори (GEVI)

Після клонування GFP медузи Aequorea victoria (О. Сімомура) і створення палітри EBFP, ECFP, EGFP, EYFP, mCherry (Р. Тсієн) з кінця 1990-х з'явилися три родини генетично кодованих індикаторів потенціалу (GEVI):

VSD-індикатори

Потенціал-чутливий домен S1–S4 каналу або фосфатази VSP + флуоресцентний білок: FlaSh (1997), SPARC, VSFP1/2, ArcLight, ASAP1, червоний FlicR1. Рух S4 змінює яскравість GFP. Оптимальні лінкери знаходять спрямованою еволюцією в E. coli.

Мікробні родопсини

PROPS, Arch: у світлозалежних протонних помп «вимкнули» транспорт, але залишили залежність протонування шиффової основи ретиналю — і слабкої флуоресценції — від потенціалу.

Гібридні FRET (hVOS)

GFP на мембрані + ліпофільний аніон дипікриламін (DPA), що перескакує між листками бішару. При деполяризації DPA наближається до GFP (< 5 нм) і гасить флуоресценцію.

Обмеження. оптичні сенсори добре показують відносну динаміку — де і коли мембрана де- чи гіперполяризується, — але абсолютні мілівольти отримати складно (потрібне калібрування). Крім того, GEVI вимагають стабільної трансформації виду рослин.

2.4Швидкі й повільні барвники

Коли трансформація неможлива (пилкові трубки ялини Picea abies чи лілії Lilium longiflorum), використовують синтетичні барвники.

ТипПрикладиМеханізмВідгук
Електрохромні (стирилові)di-4-ANEPPS, di-8-ANEPPS, RH421Хромофор у бішарі; поле зсуває спектр (ефект Штарка) — раціометріямс
PeT («молекулярний дріт»)VoltageFluor VF2.1.ClПри негативному потенціалі донор гасить флуорофор; деполяризація вимикає перенос електрона — світіння зростаємс
FRET-париоксонол + кумарин/ANEPPSПерерозподіл акцептора в бішарімс
Повільні (нернстівські)DiOCn, родаміни, DiBAC₄(3)Ліпофільні іони розподіляються за рівнянням Нернстас
кінчикпилкове зерно−120 мВ0 мВ
Псевдокольорова карта потенціалу пилкової трубки з di-4-ANEPPS: кінчик деполяризований, субапікальна й базальна зони гіперполяризовані — це збігається з апікальним входом катіонів і роботою протонних помп (Breygina et al., 2009).

Потенціал-чутливі барвники показують, що різні активні форми кисню діють протилежно: O₂•⁻ і H₂O₂ гіперполяризують мембрану, а OH• деполяризує.

Методична пастка. барвники, створені для тваринних клітин, сорбуються на гідрофобних і пектинових компонентах клітинної стінки й швидко поглинаються ендоцитозом — особливо в пилкових трубках і кореневих волосках.

Квітка лілії з пилком
Пиляки лілії з пилком: пилкові трубки лілії — модель для потенціал-чутливих барвників.Audrey from Central Pennsylvania, USA · CC BY 2.0
Пилкові трубки під мікроскопом
Пророслі й непророслі пилкові зерна: росте пилкова трубка.Melekber Sulusoglu, Aysun Cavusoglu · CC BY 4.0

2.5Везикули RSO та ISO

Помпи й транспортери працюють у 10⁴–10⁵ разів повільніше за канали, а частина обмінів електронейтральна — у патчі їхній струм не виміряти. Класичне рішення — суспензія ізольованих везикул плазмалеми чи тонопласта.

цитозольКлітинаRight-side-out (~80 %)каталітичний домен усередині — АТФ не дістаєInside-outдомен назовні: АТФ → H⁺ у везикулукаталітичний домен H⁺-АТФазифосфатидилсерин (мітка для анексину)
Після гомогенізації фрагменти плазмалеми замикаються у везикули. ~80 % з них — right-side-out (RSO): каталітичний домен H⁺-АТФази всередині й недоступний для АТФ. Двофазний розподіл декстран/ПЕГ і заморожування-відтавання (або Brij-58) дають до 80 % inside-out (ISO) везикул. Частку ISO перевіряють флуоресцентним анексином, що зв'язує фосфатидилсерин внутрішнього листка.
Віртуальний експериментЕксперимент: закислення ISO-везикул

Mg-АТФ запускає H⁺-АТФазу (H⁺ всередину везикули), CaCl₂ — Ca²⁺/H⁺-антипортер CAX, ванадат блокує P-АТФазу, NH₄Cl руйнує ΔpH.

Додавайте реагенти в кювету з везикулами та акридиновим оранжевим. Флуоресценція падає, коли везикули закислюються.

  • Регуляція кіназою PKS5: у мутанта pks5 ISO-везикули закислюються швидше, ніж у Col-0, а з конститутивно активною кіназою — повільніше. Отже, PKS5 фосфорилює та гальмує H⁺-АТФазу (Fuglsang et al., 2007).
  • Ca²⁺/H⁺-антипортер: після закислення додають CaCl₂ — сигнал повертається (залужнення), бо CAX обмінює внутрішні H⁺ на Ca²⁺; швидкість лінійно росте з [Ca²⁺] до ~40 мкМ.
Розділ 3

Системи транспорту калію: родина каналів Shaker

AKT1 · KAT1 · GORK · SKOR · CBL–CIPK23

3.1Роль калію: HATS і LATS

Калій — головний неорганічний катіон рослинної клітини: до 10 % сухої маси. Він не входить до ковалентних сполук, але виконує незамінні функції:

Ферменти і рибосоми

Стабілізує конформацію білків і активує понад 60 ферментів; Na⁺ його не замінить через іншу гідратну оболонку.

Нейтралізація зарядів

Компенсує негативні заряди органічних кислот, білків, нуклеїнових кислот у цитоплазмі й флоемі.

Осморегуляція і тургор

Ріст розтягненням коренів, гіпокотилів, пилкових трубок; рухи замикаючих клітин продихів.

Потенціал і pH

У тандемі з H⁺-АТФазою підтримує потенціал спокою та pH цитоплазми.

У цитоплазмі [K⁺] тримається на рівні 100–200 мМ, а в ґрунтовому розчині часто лише 10–200 мкМ — у тисячу разів менше. За концепцією Епштейна корінь поглинає калій двома системами:

СистемаДіапазон [K⁺] ззовніМеханізмГоловний білок
HATS (високоафінна)< 100 мкМ, особливо < 10 мкМвторинно-активний K⁺/H⁺-симпорт — потенціалу вже не вистачає для пасивного входуHAK5 (родина HAK/KUP/KT)
LATS (низькоафінна)> 0,1–1 мМпасивний вхід крізь канали завдяки негативному потенціалу від H⁺-АТФазиAKT1 (родина Shaker)
Інтерактивна модельДвофазне поглинання K⁺: дикий тип і мутанти

Рубідій (Rb⁺) — аналог K⁺ і трасер: у hak5 поглинання зникає в мікромолярному діапазоні, у akt1 — падає при вищих концентраціях.

Листки сої з ознаками дефіциту калію
Дефіцит калію в сої: хлороз і некроз країв листків.Alandmanson · CC BY-SA 4.0
Кукурудза з ознаками дефіциту калію
Дефіцит калію в кукурудзи: «підпалені» краї нижніх листків.Alandmanson · CC BY-SA 4.0

3.2Родини K⁺-транспорту і будова Shaker

У геномі Arabidopsis thaliana близько 71 гена транспорту K⁺ і неселективних катіонних каналів:

Shaker-подібні канали — 9

AKT1, AKT2/3, AKT5, SPIK (AKT6), KAT1, KAT2, AtKC1, GORK, SKOR — потенціал-залежні.

Тандем-порові TPK/KCO — 6

TPK1–TPK5, KCO3; переважно потенціал-незалежні, на тонопласті та ендомембранах.

Неселективні NSCC — 40

CNGC (20 генів) і GLR (20 генів), проникні й для Ca²⁺.

KT/HAK/KUP — 13

Високоафінні K⁺/H⁺-симпортери.

HKT — 1

AtHKT1;1 — Na⁺ або Na⁺/K⁺-транспортер (у злаків і галофітів генів багато).

CPA: KEA / NHX / CHX

K⁺/H⁺-антипортери пластид і ендомембран (KEA1–KEA6).

Функціональний канал Shaker — гомо- або гетеротетрамер: чотири α-субодиниці оточують K⁺-селективну пору. Натисніть на частини субодиниці:

СхемаБудова субодиниці Shaker (на прикладі AKT1)
АпопластЦитозольS1S2S3S4++S5S6P-петля · TVGYGNSer26C-лінкерSer338CNBDанкіриновий доменKHAсенсор потенціалу S1–S4пора S5–P–S6тетрамер, вид зверхуK⁺ у центральній порі

3.3П'ять груп каналів Shaker

За філогенією та реакцією на гіпер- чи деполяризацію 9 каналів Shaker поділяють на п'ять груп:

ГрупаКаналиТипАнкіринДе і навіщо
IAKT1, AKT5, SPIK (AKT6)вхідні випрямлячітакAKT1 — епідерміс і кора кореня (головний шлях поглинання K⁺), мезофіл; SPIK — пилок і пилкові трубки
IIKAT1, KAT2вхідні випрямлячінізамикаючі клітини: вхід K⁺ при світловій гіперполяризації відкриває продихи; завантаження флоеми
IIIAKT2слабко випрямляючий, двонаправленийтакфлоема: завантаження й розвантаження K⁺, «калієва батарея» для потенціалу ситоподібних трубок
IVAtKC1 (KAT3)«мовчазна» регуляторна субодиницяніепідерміс кореня: сама каналу не утворює, але з AKT1 зсуває поріг активації в негативний бік і не дає K⁺ витікати при бідному ґрунті
VGORK, SKORвихідні випрямлячітакGORK — продихи (вихід K⁺ при закриванні), кореневі волоски; SKOR — стела, секреція K⁺ у ксилему
Карта органівДе працюють канали Shaker

Оберіть групу — на схемі рослини залишаться відповідні органи.

Замикаючі клітини продихівKAT1, KAT2 — відкривання · GORK — закриванняФлоемаAKT2 — «калієва батарея» флоемиПилок і пилкова трубкаSPIK (AKT6) — вхід K⁺ для росту трубкиЕпідерміс і кора кореняAKT1 + AtKC1 — поглинання K⁺ з ґрунтуКореневі волоскиGORK — осморегуляціяСтела (центральний циліндр)SKOR — секреція K⁺ у ксилему
Продих під мікроскопом
Продих плектрантуса (×1000): дві бобоподібні замикаючі клітини.Codement · CC BY-SA 4.0
Розетка Arabidopsis thaliana
Розетка Arabidopsis thaliana — модельна рослина, на якій описано більшість транспортерів із цього конспекту.Charles Andrès · CC BY-SA 3.0

Чому вхідні канали рослин активуються гіперполяризацією

У нейронах K⁺-канали переважно вихідні: вони повертають потенціал до спокою після потенціалу дії. Рослинна ж плазмалема постійно гіперполяризована H⁺-АТФазами до −120…−200 мВ. Якщо зовні 100 мкМ K⁺, а всередині 100 мМ, пасивний вхід можливий лише тоді, коли Vm негативніший за EK. Канал, що відкривався б при −40 мВ, не поглинав би, а випускав калій у ґрунт за тисячократним градієнтом. Тому AKT1 і KAT1 налаштовані відкриватися лише при сильнішій гіперполяризації, а AtKC1 додатково страхує від витоку.

Головне. активатор чи інгібітор каналу змінює нахил I–V кривої (Popen або кількість активних каналів), але не зсуває точку перетину з віссю напруги: Erev залежить лише від концентрацій K⁺ по обидва боки. Перевірте повзунком «активатор» у моделі I–V розділу 1.

3.4Регуляція AKT1 комплексом CBL–CIPK

Окрім потенціалу, канали Shaker тонко регулюються pH (підкислення гальмує групу V, але активує KAT1), поліамінами, білками 14-3-3, Ca²⁺ і фосфорилюванням.

  1. Низький K⁺ зовні → кальцієвий сигналУ клітинах епідермісу й кори кореня зростає [Ca²⁺]cyt.
  2. CBL1 / CBL9 → CIPK23Кальцієві сенсори CBL1 і CBL9 (calcineurin B-like) рекрутують до плазмалеми кіназу CIPK23 і активують її.
  3. CIPK23 → AKT1Кіназа зв'язується з анкіриновим доменом AKT1 і фосфорилює канал. В ооцитах Xenopus сам AKT1 майже не дає струму — струм з'являється лише з CBL1 (або CBL9) + CIPK23 (Xu et al., 2006; Li et al., 2006).
  4. Сайти Ser26 і Ser338Специфічні для AKT1 серини: на N-кінці та в C-лінкері (їх немає в KAT1 і SKOR). Заміна S→A на обох (S26A/S338A), як і S338A, майже скасовує активацію; S26A суттєво знижує струм.
Віртуальний експериментВіртуальний TEVC: струм AKT1 в ооцитах

Порівняйте I–V криві: канал сам, з CBL1+CIPK23 і з мутаціями сайтів фосфорилювання.

AKT2 і CBL4–CIPK6. На відміну від AKT1, комплекс CBL4 (SOS3) – CIPK6 підвищує калієву провідність флоеми не фосфорилюванням воріт, а посиленням доставки каналу AKT2 з ЕР на плазмалему (Held et al., 2011).

Жаба Xenopus laevis
Шпоркова жаба Xenopus laevis: її ооцити — головна система для експресії рослинних каналів і методу TEVC.Brian Gratwicke · CC BY 2.0
Розділ 4

Тандем-порові канали TPK та натрій/калієві транспортери HKT

TPK1 · TPK3 · AtHKT1;1 · OsHKT2 · TsHKT1;2

4.1Розбір статті: NO і вітамін B₆

Розбір статтіОксид азоту негативно регулює поглинання K⁺ через AKT1, змінюючи гомеостаз вітаміну B₆Xia et al., 2014, PNAS

Суть: оксид азоту (NO) гальмує поглинання K⁺ і ріст коренів на бідному на калій середовищі — через активну форму вітаміну B₆, піридоксаль-5′-фосфат (PLP).

  1. Більше NO → більше PLPУ мутантів з високим ендогенним NO (nox1/cue1) або після донора NO (нітропрусид натрію, SNP) зростає рівень PLP, а вміст K⁺ падає.
  2. Без синтезу PLP немає ефектуУ мутанта pdx1.3 (порушений синтез B₆) поглинання K⁺ перестає реагувати на NO.
  3. PLP пригнічує AKT1 напрямуPatch clamp протопластів кореня і TEVC ооцитів з AKT1 + CBL1 + CIPK23: PLP суттєво зменшує вхідний K⁺-струм.

Методична думка з дискусії. щоб показати, що NO діє опосередковано (через синтез PLP), а не прямим S-нітрозилюванням AKT1, достатньо додати донор NO до ооцитів з AKT1+CBL1+CIPK23 без PLP: у тваринній клітині немає рослинного шляху синтезу PLP, і пригнічення не буде.

4.2Тандем-порові канали TPK

Друга родина K⁺-каналів — тандем-порові канали (TPK, раніше KCO).

TPK: 4TM / 2P → димерHKT: 4 × (M1–P–M2) в одному ланцюгуTM1TM2TM3TM4P1P2EF-hand (Ca²⁺)сайт 14-3-3фільтр GYGD · TPK1 тонопласт · TPK3 тилакоїдM1M2PAM1M2PBM1M2PCM1M2PDклас I: Ser у PA(S-G-G-G) → Na⁺-уніпортклас II: Gly у PA(G-G-G-G) → Na⁺/K⁺-симпорт
Ліворуч: субодиниця TPK має 4 трансмембранні сегменти і 2 пори (TM1–P1–TM2–TM3–P2–TM4), тож функціональний канал — димер із чотирма P-петлями; фільтр GYGD, на C-кінці 1–2 мотиви EF-hand, на N-кінці сайт 14-3-3. Виняток — KCO3 (2TM/1P). Праворуч: HKT — псевдотетрамер з чотирьох повторів M1–P–M2 в одному поліпептиді.
  • Еволюційний парадокс. Канали прокаріотів були потенціал-залежними; у вищих рослин TPK стали практично потенціал-незалежними — вони відкриваються при будь-якому потенціалі, якщо Ca²⁺ зв'язався з EF-hand і приєднався 14-3-3.
  • AtTPK1 (тонопласт). Поодинокі пА-струми слабко залежать від напруги, але потребують мікромолярного цитозольного Ca²⁺. У замикаючих клітинах TPK1 швидко випускає K⁺ з вакуолі при АБК-індукованому закриванні продихів; у tpk1 закривання уповільнене (Gobert et al., 2007).
  • AtTPK3 (тилакоїди). Регулює фотосинтез (Carraretto et al., 2013): виводить K⁺ із люмена в строму, розряджаючи електричну складову ΔΨ і перетворюючи протонно-рушійну силу на ΔpH — потрібний для синтезу АТФ і нефотохімічного гасіння (NPQ).
Інтерактивна модельПротонно-рушійна сила тилакоїда: TPK3 і KEA3

Порівняйте розподіл PMF між ΔΨ і ΔpH на яскравому світлі та після переходу в тінь у дикого типу й мутантів.

Строма (pH ~8)Люмен тилакоїда (pH ~5,5)ЕТЛсвітло → H⁺H⁺TPK3: K⁺ люмен → стромаKEA3: K⁺ ↓ / H⁺ ↑АТФ-синтаза

4.3Транспортери HKT: клас I і II

Родина HKT (High-affinity K⁺ Transporters) споріднена з бактеріальними TrkH/KtrB і грибними Trk. Один білок — це чотири повтори M1–P–M2 (8 трансмембранних спіралей, 4 пори PA–PD), що згортаються навколо центральної пори.

Клас I: Na⁺-уніпортери

AtHKT1;1, OsHKT1;5: у порі PA серин (S-G-G-G). Високоселективні до Na⁺, K⁺ не переносять.

Клас II: Na⁺/K⁺-симпортери

Лише в однодольних: OsHKT2;1, OsHKT2;2, TaHKT2;1. У PA гліцин (G-G-G-G) — переносять Na⁺ і K⁺.

Віртуальний експериментЯк довели Na⁺-селективність AtHKT1;1: зсув Erev

Змінюйте зовнішні K⁺ і Na⁺: у AtHKT1;1 Erev реагує лише на натрій. Заміна N211D робить транспортер проникним для K⁺.

Парадокс мутанта hkt1 (sas2)

Здавалося б: якщо HKT1;1 впускає токсичний Na⁺, мутант має бути стійкішим. Насправді на 50 мМ NaCl мутант hkt1 (sodium overaccumulation in shoots 2, Berthomieu et al., 2003) гине від хлорозу швидше за дикий тип.

СхемаНавіщо HKT1;1 у ксилемній паренхімі
Корінь (поперечний зріз)ксилемна паренхіма з HKT1;1 (зелене кільце)Na⁺ у листкиксилема

Рис. У рисі OsHKT2;1 при дефіциті K⁺ поглинає Na⁺ як «замінник осмоліту», майже не проводячи K⁺, а OsHKT2;2 солестійкого сорту Pokkali в культурі клітин тютюну BY-2 поглинає Rb⁺/K⁺ лише в присутності Na⁺ — класичний Na⁺/K⁺-симпортер (Horie et al., 2001).

Рослини рису в полі
Рис посівний (Oryza sativa): у злаків є HKT класу II — OsHKT2;1, OsHKT2;2.Trevor Glenn · CC BY-SA 4.0
Засолений ґрунт з білою кіркою
Засолений ґрунт із сольовою кіркою: засолення — один з головних абіотичних стресів.USDA Employee · Public domain

4.4Галофіт Thellungiella: заміна N→D

Родич Arabidopsis — галофіт Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum) — витримує 300–500 мМ NaCl (Ali et al., 2012; Ali et al., 2016).

  1. Дуплікація генаГен HKT1 тандемно подвоївся, і паралог TsHKT1;2 зберігає поглинання K⁺ навіть при надлишку Na⁺.
  2. Одна амінокислотаУ порі PB, де в глікофітів (AtHKT1;1) стоїть незаряджений аспарагін N211, у TsHKT1;2 — негативний аспартат D207. Це відновлює канонічний «калієвий» мотив, як аспартат у KcsA.
  3. Перевірка в ArabidopsisМутант hkt1-1, трансформований TsHKT1;2 або власним AtHKT1;1-N211D (заміна в позиції 242 ефекту не мала), стає солестійким: більше K⁺, менше Na⁺.
  4. Перевірка в ооцитахN211D різко зменшує вхідний Na⁺-струм і перетворює Na⁺-уніпортер на транспортер із вираженою провідністю для K⁺ — спробуйте в моделі вище.
Солерос на солончаку
Галофіти на засоленому узбережжі (солерос Salicornia) ростуть при сотнях мілімолей NaCl.Panek · CC BY 3.0
Розділ 5

Транспортери HAK/KUP/KT, хлоропластні антипортери KEA та шлях SOS

HAK5 · KUP4/9 · KEA1–3 · SOS1/2 · фосфатидна кислота

5.1Родина KT/HAK/KUP

Родина KT/HAK/KUP відсутня у тварин, але є в бактерій (KUP), грибів (HAK) і всіх рослин (13 генів в Arabidopsis). Це великі білки з 10–14 трансмембранними доменами, що працюють як K⁺/H⁺-симпортери — саме вони поглинають калій при < 10 мкМ, коли канал AKT1 уже безсилий.

Як вмикається HAK5 при калієвому голодуванні

  1. ГіперполяризаціяПри падінні K⁺ нижче 10–20 мкМ плазмалема епідермісу кореня миттєво гіперполяризується.
  2. RBOH → АФКГіперполяризація активує НАДФН-оксидази RBOHD/RBOHC, що генерують H₂O₂.
  3. Ca²⁺ → RAP2.11 → ген HAK5АФК відкривають Ca²⁺-канали; кальцієва сигнатура індукує транскрипційний фактор RAP2.11, який сідає на промотор HAK5.
  4. CBL–CIPK23 → білок HAK5Сенсори CBL1, CBL8, CBL9, CBL10 активують CIPK23, яка фосфорилює N-кінець HAK5 і переводить його у високоактивний стан (Ragel et al., 2015).

Несподівані функції білків KUP

TRH1 (KUP4) — кореневі волоски

Мутант trh1 має крихітні волоски й порушений гравітропізм, і високий K⁺ цього не виправляє. TRH1 сприяє виведенню ауксину з клітин кореневого чохлика; NPA імітує фенотип (Rigas et al., 2001; Vicente-Agullo et al., 2004).

KUP2 (shy3-1)

Точкова мутація зменшує довжину клітин гіпокотиля через слабше тургорне розтягнення.

KUP9 — меристема кореня

На мембрані ЕР клітин покоячого центру. При дефіциті K⁺ виводить K⁺ і IAA⁻ з люмена ЕР у цитозоль, підтримуючи ауксин (DR5::GFP) і поділ; у kup9 ріст кореня зупиняється (Zhang et al., 2020).

KUP5 — з аденілатциклазою

У цитоплазматичному N-кінці — каталітичний центр, що синтезує цАМФ; без нього KUP5 не рятує K⁺-дефіцитні дріжджі (Al-Younis et al., 2018).

Бічний корінь Arabidopsis у конфокальному мікроскопі
Корінь Arabidopsis із зачатком бічного кореня; флуоресцентний білок тонопласта (TIP) позначає вакуолі.S. Gattolin et al. · CC BY 2.0
Проростки на чашках Петрі
Проростки на агаризованих чашках — так тестують мутантів на дефіцит K⁺, нітрату, фосфату чи засолення.Martin Stübler · CC BY-SA 4.0

5.2Хлоропластні антипортери KEA

У хлоропластах Arabidopsis працюють три K⁺/H⁺-антипортери родини KEA (Kunz et al., 2014):

KEA1 і KEA2 — внутрішня оболонка

Великий N-кінцевий домен, переважно на полюсах пластид, що діляться. Виводять K⁺ зі строми в обмін на H⁺: регулюють об'єм пластид, pH строми, біогенез тилакоїдів. Мутант kea1;kea2: набряклі хлоропласти, бліді листки, карликовість (частково рятується NaCl).

KEA3 — тилакоїд

Антагоніст TPK3: при переході з яскравого світла в тінь закачує K⁺ у люмен в обмін на вихід H⁺ у строму. Швидко розсіює ΔpH, вимикає NPQ і підвищує квантову ефективність у тіні (видно з pH-сенсором pHluorin).

5.3Каскад дефіциту калію

Підсумкова часова схема подій у клітині кореня після різкого падіння K⁺ у ґрунті:

  1. секундиГіперполяризація плазмалемиEK стає значно негативнішим
  2. хвилиниRBOHD → H₂O₂позаклітинні та цитоплазматичні АФК
  3. хв — десятки хвПідйом [Ca²⁺]cytАФК і гіперполяризація відкривають Ca²⁺-канали
  4. посттрансляційноCBL1/9–CIPK23активує AKT1 (з AtKC1 проти витоку) і HAK5
  5. транскрипціяRAP2.11 → HAK5при < 10 мкМ увесь потік K⁺ бере на себе HAK5

5.4Семінар: фосфатидна кислота і SOS2

Розбір статтіФосфатидна кислота регулює SOS2 і гомеостаз Na⁺/K⁺ при засоленніLi et al., 2023, EMBO J.

Класичний шлях SOS. При засоленні зростає цитозольний Ca²⁺ → сенсор SOS3 (CBL4) → кіназа SOS2 (CIPK24) переходить до плазмалеми й фосфорилює Na⁺/H⁺-антипортер SOS1, який викачує Na⁺. Питання статті: як фосфатидна кислота (PA), яку при сольовому стресі швидко синтезують фосфоліпази D (PLDα1, PLDδ), регулює SOS2 і баланс Na⁺/K⁺?

Lipid overlay

Ліпіди на нітроцелюлозі + His-SOS2: SOS2 дозозалежно зв'язує лише PA (16:0–18:1, 18:0–18:1, 16:0–16:0), не PC, PE, PI, PS чи PG. Контроль His-RBOHD — не зв'язує.

Коседиментація з ліпосомами

Ліпосоми з PC ± PA + SOS2 → ультрацентрифугування: SOS2 в осаді лише з PA.

Мікротермофорез (MST)

Мічений SOS2 у капілярах з ІЧ-градієнтом температури: зв'язування PA змінює рухливість — крива насичення і Kd.

Схема і даніPA–SOS2 при засоленні: дикий тип і мутанти
Апопласт · NaClЦитозольPLDα1 / PLDδфосфатидна кислота (PA)SOS2 (CIPK24)Lys57 ↔ PASOS3 (CBL4) + Ca²⁺SOS1Na⁺ назовніфосфорилюванняK⁺ всередину (AKT1)підтримка надходження K⁺

  • Без NaCl мутанти pldα1;pldδ, sos2-2 і CRISPR-лінії не відрізняються від Col-0: каскад PA–SOS2 — суто адаптивна відповідь, а не «домашнє господарство» клітини.
  • При 75–100 мМ NaCl ріст коренів гальмується, ефлюкс Na⁺ падає, вихід K⁺ зростає, Na⁺/K⁺ у тканинах — у 3–3,5 раза вище. Неадитивність подвійних мутантів доводить: PLD/PA і SOS2 — в одному шляху.
  • Сайт зв'язування. PA заряджена негативно, тож перевірили лізини й аргініни кіназного домену (24, 35, 38, 57…). Заміна K57G повністю скасовує зв'язування з PA.
  • Фракціонування мембран. Маркери: цитозольна PEPC і мембранний GHR1. При засоленні SOS2 дикого типу накопичується на плазмалемі, а SOS2K57G (або SOS2 у pldα1;pldδ) — ні, і солестійкість не відновлюється. Крім SOS1, PA-активна SOS2 підтримує роботу AKT1 і надходження K⁺.
Розділ 6

Транспорт кальцію та кальцієва сигналізація

CNGC14 · GLR3.3/3.6 · TPC1 · RBOHD · YC3.6

6.1Компартменти і кальцієві сигнатури

Кальцій у рослині виконує дві ролі: структурну (зшиває пектини клітинної стінки, стабілізує мембрани) і сигнальну — універсальний вторинний месенджер, що регулює канали, кінази, екзоцитоз і цитоскелет.

Ca²⁺ легко осаджується з фосфатом — основою енергетики клітини (АТФ). Тому вільний Ca²⁺ у цитозолі тримається на рівні ~100 нМ, а в депо — на 4–5 порядків вище:

Цитозоль~100 нМ>99 % Ca²⁺ зв'язано буферними білками
Ядро~100 нМвласні ядерні осциляції (напр., при симбіозі)
Строма хлоропласта~150 нМзагальний Ca²⁺ до 15 мМ (зв'язаний у тилакоїдах)
Матрикс мітохондрій~200 нМрегулює дегідрогенази циклу Кребса
Пероксисоми0,15–2 мкМдетоксикація АФК
ЕРдо 0,5 мМмобільне депо з кальретикуліном
Апопласт~1 мМзв'язаний з пектинами, жорсткість стінки
Вакуоля1–5 мМ (зв'язаний — до 80 мМ)головне депо Ca²⁺ клітини
100 нМ1 мкМ10 мкМ100 мкМ1 мМ
Концентрація вільного Ca²⁺ у компартментах клітини в стані спокою (логарифмічна шкала).

Головне. 10 000-кратна різниця концентрацій, негативний потенціал (−120…−180 мВ) і заряд +2 означають, що електрохімічний градієнт Ca²⁺ завжди спрямований у цитозоль — з апопласту, вакуолі, ЕР. Досить на мить відкрити кальцієві канали, і Ca²⁺ хлине всередину.

Кальцієва сигнатура

Ультрафіолет, тепло і холод, посуха, засолення, важкі метали, дотик, поранення, H₂O₂, ауксин, АБК, еліситори патогенів — майже все підвищує [Ca²⁺]cyt. Клітина розрізняє стимули за сигнатурою: амплітуда, тривалість, частота осциляцій, лаг-фаза, локалізація. Її розшифровують декодери — кальмодуліни (CaM), CML, кінази CDPK/CPK, комплекси CBL–CIPK.

Інтерактивна модельКальцієві сигнатури різних стимулів

Схематичні сигнатури за даними літератури. Зверніть увагу: форму піку визначає не лише вхід, а й швидке видалення Ca²⁺.

Для чіткої сигнатури видалення Ca²⁺ проти градієнта не менш важливе, ніж вхід: високоафінні Ca²⁺-АТФази P-типу (ACA — автоінгібовані кальмодулін-регульовані, ECA — типу ЕР), низькоафінні високоємні Ca²⁺/H⁺-антипортери CAX, буферні білки й ліпіди.

6.2Кальцієві канали рослин

У тварин збудливі клітини використовують потенціал-залежні Ca²⁺-селективні канали CaV. Після секвенування геному Arabidopsis виявилося: у наземних рослин гомологів CaV немає зовсім. Кальцієву провідність забезпечують неселективні або помірно селективні катіонні канали.

HACC — гіперполяризаційно-активовані

Відкриваються при негативних потенціалах; пов'язані з CNGC та аннексинами. Ріст кореневих волосків і пилкових трубок, закривання продихів.

VICC — потенціал-незалежні

Лінійна I–V у широкому діапазоні; базове живлення Ca²⁺ і сигнальні потоки (GLR, частина CNGC).

DACC — деполяризаційно-активовані

Активуються при стресовій деполяризації; довго лишалися неідентифікованими (частково механочутливі канали, TPC1).

CNGC — 20 генівGLR — 20 генівTPC1 — 1 генMSL — 10MCA — 2OSCA — 15PIEZO — 1

6.3CNGC, сенсор YC3.6 і гравітропізм

Субодиниця CNGC має 6 трансмембранних сегментів і P-петлю між S5 і S6 — топологія як у Shaker, але пора неселективна: Ca²⁺, K⁺, Na⁺. У C-кінці — CNBD (цАМФ або цГМФ відкривають канал) і IQ-домен / CaMBD для кальмодуліну, що дає кальцій-залежний зворотний зв'язок.

Як «бачать» Ca²⁺: FRET-сенсор Yellow Cameleon 3.6

Інтерактивна модельСенсор YC3.6: CFP – кальмодулін – M13 – YFP

Збуджуємо CFP (≈ 435 нм). Без Ca²⁺ світиться блакитним (480 нм); з Ca²⁺ кальмодулін обгортає M13, стягує CFP і YFP — енергія переходить на YFP (535 нм). Відношення YFP/CFP не залежить від товщини препарату.

Методичне застереження. білок на основі кальмодуліну під сильним промотором (35S) у великій кількості сам зв'язує вільний Ca²⁺ і штучно збільшує буферну ємність цитозолю — реакції клітини спотворюються. Відбирають лінії з мінімально достатньою експресією й перевіряють, що фенотип не відрізняється від дикого типу.

CNGC14: ауксин, Ca²⁺ і гравітропізм (Shih et al., 2015)

  1. Секунди після ауксинуЗадовго до змін транскрипції: стрімкий підйом Ca²⁺ (YC3.6) і залужнення поверхні кореня (гальмується H⁺-АТФаза).
  2. Два незалежні алеліcngc14-1 і cngc14-2: при Т-ДНК мутагенезі можливі фонові інсерції, тож лише однаковий фенотип двох алелей доводить роль саме цього гена.
  3. СпецифічністьУ мутантів зникає і Ca²⁺-пік, і залужнення на ауксин, а відповідь на позаклітинний АТФ збережена.
  4. ГравітропізмПоворот проростка на 90°: ауксин на нижньому боці → через 5 хв Ca²⁺ і pH ↑ → клітини нижнього боку гальмують ріст → корінь гнеться вниз. У cngc14 асиметричного сигналу немає, вигин затриманий, хоча амілопласти-статоліти нормальні.
Корінь Arabidopsis з волосками
Корінь Arabidopsis з кореневими волосками.G Lens Microscopist, Megan Gerber · CC BY 4.0
Структура сенсора GCaMP
GCaMP: кругово-пермутований GFP, кальмодулін і пептид M13 — зв'язування Ca²⁺ посилює світіння.Akerboom, Rivera, Guilbe, Malavé, Hernandez, Tian, Hires, Marvin, Loog · CC BY 4.0

6.4Канали GLR: мох і поранення

GLR (20 генів в Arabidopsis) — гомологи іонотропних глутаматних рецепторів синапсів хребетних (AMPA/каїнатних, NMDA). Субодиниця: позаклітинний N-кінцевий домен, ліганд-зв'язуючий домен (LBD) для глутамату, гліцину, серину, цистеїну, три трансмембранні M1–M3 і P-петля. Тетрамер з високою проникністю для Ca²⁺.

Розбір статтіGLR потрібні для хемотаксису сперматозоїдів мохуOrtiz-Ramírez et al., 2017, Nature

У квіткових 20 генів GLR дублюють один одного, тож автори взяли мох Physcomitrium patens, де лише 2 гени (PpGLR1, PpGLR2).

  • Patch clamp протопластів протонеми й експресія в клітинах COS-7: PpGLR1 — Ca²⁺-проникний канал плазмалеми, струм зростає з Ca²⁺ і блокується DNQX/CNQX.
  • У ppglr1;ppglr2 дводжгутикові сперматозоїди пливуть з нормальною швидкістю, але не знаходять вхід в архегоній і не індукують BELL1, потрібний для розвитку зиготи.
Мох Physcomitrella patens
Мох Physcomitrium (Physcomitrella) patens: у геномі лише два гени GLR.Pirex at English Wikipedia · Public domain
Розбір статтіГлутамат запускає далеку кальцієву сигналізацію при пораненніToyota et al., 2018, Science

Гусінь кусає листок №1 — і за 40–120 с у віддаленому листку №6 спалахує хвиля Ca²⁺, що запускає синтез жасмонатів.

  • Візуалізація: біолюмінесценція екворину (апоекворин + целентеразин, у повній темряві) і флуоресцентний GCaMP3 — видно, як хвиля йде провідними пучками.
  • Механізм: зруйновані клітини вивільняють L-глутамат в апопласт; крапля 100 мМ глутамату на кінчик листка відтворює хвилю. У glr3.3;glr3.6 (GLR3.3 — флоема, GLR3.6 — ксилемна паренхіма) системна хвиля і електричний сигнал зникають.
Гусінь на листку
Гусінь їсть листок: поранення вивільняє глутамат і запускає системну Ca²⁺-хвилю.Pseudopanax at en.wikipedia · Public domain
Розетка Arabidopsis thaliana
Розетка Arabidopsis thaliana — модельна рослина, на якій описано більшість транспортерів із цього конспекту.Charles Andrès · CC BY-SA 3.0

6.5TPC1 і системні хвилі

TPC1 — єдиний ген в Arabidopsis, відповідає за класичний повільний вакуолярний (SV) струм (Peiter et al., 2005). Функціональний канал — гомодимер; кожен мономер — два Shaker-подібні 6-TM домени (S1–S12, пори P1 і P2) з власними сенсорами напруги, а між ними — два мотиви EF-hand. Канал проводить K⁺, Na⁺, Ca²⁺; відкривається, коли цитозольний Ca²⁺ сідає на EF-hand, а високий вакуолярний Ca²⁺ його гальмує.

Розбір статтіСольова Ca²⁺-хвиля від кореня до пагонаChoi et al., 2014, PNAS

Кінчик кореня в NaCl → за ~3 хв хвиля Ca²⁺ (YC3.6) досягає листків зі швидкістю ~400 мкм/с. Дифузія Ca²⁺ на таку відстань неможлива — працює естафета: Ca²⁺-індуковане вивільнення Ca²⁺ разом з хвилею АФК.

  • Аскорбат, інгібітор НАДФН-оксидази DPI, нокаути tpc1 і rbohd різко гальмують хвилю.
  • Апопластний зонд OxyBURST-BSA (пришитий до альбуміну, щоб не проникав у клітини) показав хвилю АФК уже через 30 с — у tpc1 її немає.
  1. Вхід Ca²⁺Первинний Ca²⁺ через канали плазмалеми активує EF-hand і кінази.
  2. RBOHD → H₂O₂НАДФН-оксидаза викидає супероксид / H₂O₂ в апопласт сусідньої клітини.
  3. АФК → Ca²⁺-канали сусідаАФК-чутливі канали сусідньої клітини впускають Ca²⁺.
  4. TPC1 підсилюєCa²⁺ сідає на EF-hand TPC1 — масований викид з вакуолі; естафета йде далі до пагона.
СимуляціяСистемна хвиля Ca²⁺ / АФК

Кожен прямокутник — клітина на шляху сигналу. Колір — рівень цитозольного Ca²⁺.

Розділ 7

Механочутливі канали та кальцій-залежний екзоцитоз у пилку

MSL · MCA · OSCA · PIEZO · CNGC18

7.1Навіщо рослині механорецепція

Найвідоміші швидкі механореакції — венерина мухоловка (Dionaea muscipula) і мімоза сором'язлива (Mimosa pudica): потенціали дії й скидання тургору в моторних клітинах. Але механочутливість — властивість кожної клітини рослини:

Листки мімози сором'язливої
Мімоза сором'язлива: листочки складаються від дотику через швидке скидання тургору.NonNerd · CC0
Малюнок листка мімози
Листок мімози відкритий і складений після подразнення (ілюстрація 1911 р.).Reginald Innes Pocock · Public domain
Пастка венериної мухоловки
Пастка венериної мухоловки: дотик до чутливих волосків генерує потенціали дії.che · CC BY-SA 2.5
Харова водорость Chara
Харова водорость Chara: гігантські клітини міжвузлів — класичний об'єкт електрофізіології.Show_ryu · CC BY-SA 3.0
Гравітропізм і перешкоди

Амілопласти-статоліти колумели осідають і тиснуть на мембрани та актин, перерозподіляючи PIN-транспортери ауксину (у харових — барієві статоліти ризоїдів). Натрапивши на скло, корінь тимчасово «вимикає» гравітропізм, щоб обійти перешкоду.

Тигмоморфогенез

Вітер чи щоденне погладжування розетки Arabidopsis гальмують видовження стебла — рослина стає компактною і міцною.

Форма меристеми

Кортикальні мікротрубочки шикуються вздовж ліній механічного напруження і скеровують целюлозу (Hamant et al., 2008; перевірено лазерною абляцією).

Осморегуляція

Гіпо- чи гіперосмотичний шок миттєво змінює об'єм клітини й натяг мембран.

Зріз апекса пагона
Апекс пагона на зрізі: форму меристеми задають поля механічних напружень.Kingfiser · CC BY-SA 4.0

7.2MSL, MCA, OSCA, PIEZO

MSL5–6 TM × 7 (гептамер)аніонні, «осмотичний клапан»MCA1 TM + EF-hand + PLAC8, тетрамерCa²⁺, натяг ліпідівOSCA11 TM, димерCa²⁺, гіперосмолярністьPIEZO38 TM × 3, «пропелер»Ca²⁺, кінчик кореня
Чотири родини механочутливих каналів рослин — топологія субодиниць.
РодинаГени (Arabidopsis)БудоваЩо відомо
MSL (MscS-like)10: MSL1–10гомо/гетерогептамери, 5–6 TMMSL1 — мітохондрії; MSL2/3 — пластиди (захист від розриву, поділ); MSL4–10 — плазмалема (MSL9/10 — корінь, MSL8 — пилок). Висока провідність, переважно аніони (Cl⁻, NO₃⁻) — «осмотичний клапан».
MCA (Mid1-complementing)2: MCA1, MCA21 TM + EF-hand + coiled-coil + PLAC8; тетрамерЛише в наземних рослин; відкриті за комплементацією дріжджового mid1. Корені mca1;mca2 не пробивають щільний агар і гинуть при нестачі Ca²⁺.
OSCA159–11 TM, димер; тваринні гомологи TMEM63 — теж механочутливіОсмосенсор OSCA1 знайдено скринінгом з екворином; OSCA1.3 — імунне закривання продихів.
PIEZO1: AtPIEZO1«пропелер», 38 TM на мономер, тримерКінчик кореня (колумела) і судини; без нього корінь не проникає крізь твердий субстрат; на тонопласті — морфологія вакуолей, імунітет до вірусів.

Ключові експерименти

MSL10 — сигнал смерті

П'ятикратний мутант msl4;5;6;9;10 майже втрачає механочутливий струм, але росте нормально. Натомість надекспресія MSL10 або дефосфомімік MSL10-7A викликає H₂O₂, гени стресу (ZAT10) і загибель клітин; фосфомімік 7D — ні (Veley et al., 2014).

MCA1 у чистих ліпосомах

N-кінцевий фрагмент MCA1 (173 а.к.), синтезований у безклітинній системі, вбудували в ліпосоми без цитоскелета і стінки: Popen зростає пропорційно тиску до 100 мм рт. ст. — канал відкривається натягом ліпідів (Nakano et al., 2011).

OSCA1: скринінг з екворином

Мутагенізовані проростки + сорбітол у темряві → спалах екворину. Калібрування: наприкінці клітини пермеабілізують з надлишком CaCl₂ і вимірюють залишок Lmax. У osca1 пік удвічі менший, продихи й ріст коренів погано реагують на осмотичний стрес (Yuan et al., 2014).

OSCA1.3 і бактерії

flg22 → FLS2–BAK1 → кіназа BIK1 фосфорилює Ser54 OSCA1.3 → вхід Ca²⁺ у замикаючі клітини → продих закривається перед патогеном; АБК-закривання в osca1.3 нормальне (Thor et al., 2020).

AtPIEZO1

Ортолог нобелівських PIEZO (А. Патапутян, 2021). PIEZO::GUS — кінчик кореня; у piezo-1 немає Ca²⁺-відповіді на щільний бар'єр (Mousavi et al., 2021).

7.3Семінар: проростання пилку

Розбір статтіПеріодична доставка везикул з AtFH5 і CNGC18 запускає осциляції Ca²⁺ при проростанні пилкуRuan et al., 2023

Питання: як симетричне гідратоване зерно обирає одну точку, де стінка розм'якне, випнеться і з'явиться пилкова трубка? Стежили одночасно за Ca²⁺ (GCaMP6) і секреторними везикулами з форміном AtFH5 (mRFP/GFP).

Артефакт конфокальної мікроскопії. якщо зерно під час зйомки нахиляється відносно оптичного зрізу, змінюється яскравість без реальної зміни Ca²⁺. Тому зерна фіксували в низькоплавкій агарозі під сталим кутом.

Схема і даніПроростання пилкового зерна крок за кроком
везикули з AtFH5 і CNGC18 · актинвезикуласпалах Ca²⁺пектини

  • Звідки Ca²⁺? GdCl₃ (блокатор каналів) або EGTA (не проникає в клітину) знижують амплітуду піків, подовжують інтервали і блокують проростання, а базовий рівень не змінюється; іонофор A23187 піки збільшує. Мутант cngc18 — точна фенокопія: джерело спалахів — зовнішній Ca²⁺ через CNGC18.
  • Везикули і Ca²⁺: везикули з FH5 2–3 рази обходять периферію зерна, потім зупиняються в майбутній точці проростання. Після кожного спалаху Ca²⁺ сигнал FH5 на плазмалемі зростає сходинками — кожен імпульс запускає хвилю екзоцитозу (позитивний зворотний зв'язок).
  • Актин: латрункулін B, цитохалазин D або мутація fh5 розсіюють везикули — фокусованих спалахів немає. (Лекторка зауважує: у кореневих волосках актин доставляє везикули, а вісь росту задають мікротрубочки й градієнт Ca²⁺.)
  • Пектини: ТЕМ і пропідій йодид показали потовщений шар секретованих пектинів на фронті випинання.
Пилкова трубка з флуоресцентним сенсором кальцію
Кальцій у пилковій трубці: флуоресцентний сенсор показує сигнал біля кінчика.G Lens Microscopist, Nicholas Majkut · CC BY 4.0
Пилок лілії з пилковими трубками
Пилкові зерна лілії, що проростають (скануюча електронна мікроскопія).Neutr0nics · CC BY-SA 3.0
Пилкові зерна
Пилкові зерна під конфокальним мікроскопом.Heiti Paves · CC BY-SA 3.0
Розділ 8

Аніонні канали SLAC, CLC, ALMT та модель гідратації пилку

SLAC1 · OST1 · AtClC-a · ALMT1/12 · MSL8

8.1Аніони: R- і S-струми

Плазмалема заряджена мінусом усередині (−120…−180 мВ), а аніони (Cl⁻, NO₃⁻, малат²⁻) накопичуються в цитоплазмі до мілімолярних концентрацій симпортом з H⁺. Тому електрохімічний градієнт для всіх аніонів спрямований назовні. Відкриття аніонних каналів одразу дає:

Швидку глибоку деполяризацію

Клітина втрачає негативні заряди — відкриваються деполяризаційно-активовані вихідні K⁺-канали (GORK у замикаючих клітинах).

Вихід осмолітів і води

Аніони + K⁺ + вода залишають клітину — тургор падає, продихова щілина закривається.

У 1989–1992 рр. лабораторії Дж. Шредера і К. Рашке методом patch clamp знайшли в протопластах замикаючих клітин два типи аніонних струмів (Schroeder & Hagiwara, 1989; Linder & Raschke, 1992):

Інтерактивна модельR- і S-тип аніонних струмів

Струми при деполяризуючій сходинці: R-тип (ALMT12/QUAC1) вмикається за мілісекунди й інактивується; S-тип (SLAC1) повільний і тривалий.

8.2SLAC1 і закривання продихів

Як знайшли SLAC1: тепловізор

Двадцять років S-струм був «безіменним». Ген знайшли одночасно дві групи (Vahisalu et al., 2008; Negi et al., 2008). Відкриті продихи випаровують воду й охолоджують листок; при CO₂, посусі, озоні чи АБК продихи закриваються — і листок нагрівається. Інфрачервона камера виявила мутанти slac1, листки яких лишалися холодними: продихи не могли закритися. SLAC1-GFP — на плазмалемі замикаючих клітин; у slac1 повністю зник S-струм, а R-струм і Ca²⁺-струми лишилися.

Тепловізійне зображення листків
Інфрачервоне зображення листків томата: транспіруючий листок холодніший — на цьому принципі знайшли мутанти slac1.Bakanae · CC BY-SA 3.0
Відкритий і закритий продихи
Відкритий і закритий продих: тургор замикаючих клітин змінюється потоками K⁺, аніонів і води.KuriPop · CC BY-SA 3.0
Структура SLAC1

Гомотример; кожна субодиниця — 10 трансмембранних спіралей (5 пар шпильок), пора ~5 Å. У закритому стані прохід перекриває кільце Phe450; фосфорилювання N- і C-кінців повертає спіралі й відводить «заслінку» (Chen et al., 2010, за гомологом TehA).

SLAH1–SLAH4

SLAH2 і SLAH3 працюють і в коренях: завантаження NO₃⁻ і Cl⁻ у ксилему, деполяризація при гіпоосмотичному набуханні. Гомологи вивчають і на гігантських клітинах Chara.

Мережа сигналів, що відкриває SLAC1

Інтерактивна мережаЗакривання продиху: АБК, Ca²⁺ і CO₂

Увімкніть один або кілька стимулів і подивіться, які ланки активуються. Червоні риски — гальмування.

Стимули

Мутанти

АБКPYR/PYL/RCARABI1/2 (PP2C)Ca²⁺CPK6/21/23CBL1/9–CIPK23CO₂βCA1/4 → HCO₃⁻RHC1 / MPK4/12HT1OST1 (SnRK2.6)SLAC1 (S-тип)ALMT12 (R-тип)AtClC-a (тонопласт)аніони назовні → деполяризаціяGORK: K⁺ назовнівода назовні → продих закривається
  1. Кальцій-незалежна гілка АБКБез стресу фосфатази PP2C (ABI1, ABI2, HAB1) тримають OST1 і SLAC1 дефосфорильованими. АБК + рецептори PYR/PYL/RCAR блокують ABI1 → вільна OST1 фосфорилює SLAC1 (Ser120).
  2. Кальцій-залежна гілкаCa²⁺ активує CPK6, CPK21, CPK23 і той самий модуль CBL1/9–CIPK23, що регулює AKT1 і NRT1.1; вони фосфорилюють SLAC1 і SLAH3 (напр., Ser59).
  3. CO₂ і бікарбонатβ-карбоангідрази βCA1/βCA4 перетворюють CO₂ на HCO₃⁻. Бікарбонат може діяти на трансмембранний домен SLAC1 (без N- чи C-кінця канал не реагує на АБК, але частково — на CO₂) і через RHC1 (або MPK4/MPK12) гальмує кіназу HT1 — негативний регулятор, що при низькому CO₂ тримає продихи відкритими. «Інгібування інгібітора» знімає блок з OST1/GHR1.

8.3Родина CLC і AtClC-a

Родина CLC є і в тварин, і в рослин (7 генів AtClC-a…g). У людини мутації CLC викликають тяжкі каналопатії:

синдром Барттера, хвороба Дента (ClC-Kb, ClC-5)міотонія Томсена і Беккера (ClC-1)остеопетроз (ClC-7)епілепсія, нейродегенерація

У рослин усі CLC — на внутрішніх мембранах: AtClC-a, -b, -c, -g — тонопласт; AtClC-d, -f — Гольджі і TGN (разом з V-АТФазою регулюють pH люмена); AtClC-e — тилакоїди.

Розбір статтіAtClC-a — нітрат/протонний антипортер вакуоліDe Angeli et al., 2006, Nature

Patch clamp ізольованих вакуолей дикого типу і clca дав три відкриття:

  1. Не канал, а антипортерAtClC-a — вторинно-активний обмінник.
  2. Субстрат — нітратСелективність до NO₃⁻ значно вища, ніж до Cl⁻.
  3. Стехіометрія 2NO₃⁻ : 1H⁺Визначена за зсувом Erev при зміні нітрату й pH. Протонний градієнт V-АТФази і V-PPase «качає» два NO₃⁻ у вакуолю за один вихідний H⁺. Вакуоля запасає 50–90 % клітинного нітрату; у clca — удвічі менше.
Інтерактивна модельAtClC-a як сенсор енергії: АТФ проти АМФ

Два CBS-домени на C-кінці зв'язують аденілові нуклеотиди: АТФ гальмує транспорт до 60 %, АМФ конкурує й знімає блок (De Angeli et al., 2009).

У замикаючих клітинах AtClC-a закачує NO₃⁻ у вакуолю при відкриванні продихів, а при дії АБК кіназа OST1 фосфорилює її N-кінець — і обмін змінюється на вихід аніонів з вакуолі; у clca реакція продихів на АБК порушена (Wege et al., 2014).

8.4Родина ALMT

Назва родини ALMT (14 генів) — від першого гена стійкості до алюмінію в пшениці (TaALMT1, Sasaki et al., 2004).

ALMT1 — захист від Al³⁺

У кислих ґрунтах (pH < 5) алюмосилікати віддають токсичний Al³⁺, що зупиняє ріст коренів. AtALMT1 в епідермісі кореня активується позаклітинним Al³⁺ і викидає малат, який хелатує алюміній у ризосфері.

ALMT9 і ALMT6 — тонопласт

У замикаючих клітинах і мезофілі; ALMT9 активується цитозольним малатом і впускає малат і Cl⁻ у вакуолю при відкриванні продихів.

ALMT12 (QUAC1) — R-тип

Плазмалема замикаючих клітин: швидкий потенціал-залежний канал для малату, сульфату, нітрату; активується OST1. У almt12 зникає R-струм, продихи погано закриваються на АБК, CO₂, темряву (Meyer et al., 2010).

Корені кукурудзи з ознаками токсичності алюмінію
Корені кукурудзи, пошкоджені алюмінієм у кислому ґрунті.Alandmanson · CC BY 4.0

8.5Семінар: модель гідратації пилку

Розбір статтіЧи є MSL8 простим «осмотичним клапаном» пилку? Математична модель гідратаціїBaird et al., 2022, Current Biology (лабораторія Е. Хасвелл)

Феномен. Сухе видовжене пилкове зерно у воді стрімко набухає й округлюється. У дикого типу об'єм росте ~28 с і виходить на плато, розривається ~2 % зерен. У мутанта msl8 об'єм росте далі, а розривів — ~12 %. Класична гіпотеза: натяг мембрани відкриває MSL8, аніони виходять, тиск падає — зерно врятоване. Автори перевірили її моделюванням.

σ(r)=Km·r−R0R0(8.1)
drdt=Lp[RT(cin−cout)−Pwall(r)](8.2)
dSdt=−kflux(σ−σopen)Sr3приσ>σopen,cin=S43πr3(8.3)
Математична модельМодель гідратації пилкового зерна

Чисельне розв'язання рівнянь 8.1–8.3 з модифікаціями. Порівняйте моделі з дикого типом, msl8 і надекспресором MSL8-YFP; PEG підвищує cout. Параметри умовні — важлива якісна поведінка.

  1. Модель 1 провалиласяНатяг мембрани в рази перевищував літичний поріг уже на перших секундах; дикий тип давав нереальний «горб» об'єму, а мутант не збігався з експериментом.
  2. Модифікація 1: складки мембрани ε₀У сухому зерні мембрана зібрана в складки — спершу розправляється без натягу. Розрахунковий натяг опустився нижче порогу розриву (перевірено пересушуванням пилку).
  3. Модифікація 2: нелінійна стінка pcЖорсткість стінки експоненційно зростає після критичного тиску. Мутант відтворено, але в дикого типу лишився «горб».
  4. Три моделі MSL8D — канал інактивується з часом: провалила тести з PEG і надекспресією. E — канал закривається, коли натяг починає спадати: пройшла всі тести. F — іони з MSL8 зміцнюють клітинну стінку: теж відповідає даним (а непровідний поро-мутант MSL8 показав, що сам іонний потік необхідний).

Критика на семінарі. у рівняння ввели багато невідомих (S₀, Lp, ε₀, pc, константи інактивації), підігнаних під одну криву (overfitting). Моделі E і F однаково добре описали всі перевірки (E навіть точніше на плато), прямих доказів зміцнення стінки аніонами немає — але в заголовку й анотації наголошено лише на F. Водночас, як підкреслила Т. М. Бібікова з посиланням на Д. Косгроува, саме механіка клітинної стінки зазвичай лімітує розширення клітини.

Розділ 9

Транспортери нітратів і фосфатів та мембранні АТФази

NRT1.1 · NRT2.1 · PHT1 · AHA2 · ACA · V-АТФаза

9.1Нітрат і трансцептор NRT1.1

Головна форма азоту в аеробних ґрунтах — нітрат (NO₃⁻). Плазмалема заряджена негативно, а в клітині нітрату часто більше, ніж у ґрунті, тому поглинання — активний симпорт 2H⁺ : 1NO₃⁻ за рахунок протонно-рушійної сили H⁺-АТФази.

СистемаДіапазон [NO₃⁻]Родина
LATS (низькоафінна)> 0,5 мМNRT1 / PTR = NPF (53 гени в Arabidopsis, до 130 у вищих рослин)
HATS (високоафінна)< 0,2–0,5 мМNRT2 (7 генів) у парі з білком NAR2.1 (NRT3.1)

CHL1 / AtNRT1.1 / NPF6.3 — перший клонований еукаріотичний транспортер нітрату (І-Фан Цай і Дж. Шредер, Tsay et al., 1993). Мутант chl1 стійкий до гербіциду хлорату, бо не поглинає його разом з нітратом.

Інтерактивна модельТрансцептор NRT1.1: дві афінності, сигнал і ауксин

Змініть концентрацію нітрату або оберіть мутант: перемикач — фосфорилювання Thr101 кіназою CIPK23 (з CBL9).

Дуальна афінність

Низький NO₃⁻: зайнятий лише високоафінний сайт, Thr101 доступний CIPK23 → фосфорильований мономер, Km ≈ 50 мкМ. Високий NO₃⁻: обидва сайти зайняті, кіназа не дістає → нефосфорильований димер, Km ≈ 4 мМ (Liu et al., 1999).

Трансцептор = транспортер + рецептор

Первинна відповідь на нітрат — індукція NRT2.1 — зникає в chl1-5 (білка немає), але зберігається в chl1-9 (P492L: білок є, а транспорту немає). Отже, щоб «повідомити» про нітрат, переносити його не обов'язково (Ho et al., 2009). T101D дає слабку відповідь, T101A — надіндукцію.

Нітрат керує ауксином

NRT1.1 переносить ауксин; нітрат дозозалежно гальмує цей транспорт (але не навпаки). Без нітрату NRT1.1 відкачує ауксин з верхівки зачатка бічного кореня — корінь не росте в бідну зону; у зоні з нітратом ауксин накопичується, і бічний корінь росте (Krouk et al., 2010).

Бічний корінь Arabidopsis у конфокальному мікроскопі
Корінь Arabidopsis із зачатком бічного кореня; флуоресцентний білок тонопласта (TIP) позначає вакуолі.S. Gattolin et al. · CC BY 2.0
Кукурудза з ознаками дефіциту калію
Дефіцит калію в кукурудзи: «підпалені» краї нижніх листків.Alandmanson · CC BY-SA 4.0

9.2NRT2 і пептидний сигнал CEP

У Arabidopsis 7 генів NRT2: поглинання з ґрунту — NRT2.1, 2.2, 2.4, 2.5; NRT2.7 — на тонопласті дозріваючого насіння. Як корінь у «голодній» зоні повідомляє решту рослини, що треба посилити поглинання? (Ohkubo et al., 2017; 2021)

СхемаПетля «корінь → пагін → корінь»
бідна на N зонабагата на NO₃⁻ зона1 · CEP12 · ксилема ↑3 · CEPR1 у листку4 · CEPD1/2 по флоемі ↓5 · CEPH ⊣ P-Ser501NRT2.1 активний

Карта транспортерів нітрату в цілій рослині

ЕтапТранспортери
Поглинання з ґрунтуNRT2.1, NRT2.2, NRT2.4, NRT2.5 (високоафінні) · NRT1.1/NPF6.3 (дуальний) · NRT1.2/NPF4.6 (низькоафінний)
Виведення в ризосферу при стресіNPF2.7 (NAXT1)
Ксилема: корінь → пагінNRT1.5/NPF7.3 завантажує; NRT1.8/NPF7.2 і NRT1.9/NPF2.9 розвантажують і повертають у флоему (важливо при Cd і NaCl)
Ремобілізація і насінняNRT1.7/NPF2.13 — флоема старих листків; NRT1.6/NPF2.12, NPF5.5, вакуолярний NRT2.7 — зародок

9.3Фосфат і родина PHT

Фосфор рослини беруть лише як ортофосфат (Pᵢ: H₂PO₄⁻ / HPO₄²⁻). У ґрунті його 1–10 мкМ, у цитоплазмі — 5–10 мМ. Надлишок добрив виснажує запаси фосфоритів і спричиняє евтрофікацію водойм.

Кукурудза з ознаками дефіциту фосфору
Дефіцит фосфору в кукурудзи на кислому ґрунті: пурпурові антоціанові листки.Alandmanson · CC0
Супутниковий знімок цвітіння водоростей
Цвітіння водоростей у Балтійському морі (знімок Sentinel-2) — наслідок надлишку азоту й фосфору.European Union, Copernicus Sentinel-2 imagery · CC BY (атрибуція)
  1. Доказ H⁺/Pᵢ-симпортуДодавання Pᵢ до кореня: Pᵢ зникає з розчину, зовнішній pH росте, цитозоль тимчасово підкислюється, плазмалема деполяризується — електрогенний симпорт 2–4 H⁺ : 1 H₂PO₄⁻.
  2. Функціональна комплементація дріжджівШтам Δpho84 (без власного високоафінного транспортера) гине на низькому фосфаті. Бібліотека кДНК з коренів «голодного» Arabidopsis → трансформація → виживають лише колонії з робочим рослинним геном: так клоновано PHT1;1 і PHT1;4 (Muchhal et al., 1996).
Колонії дріжджів на агарі
Колонії дріжджів Saccharomyces cerevisiae: функціональна комплементація мутантів дріжджів дала перші гени PHT1.A doubt · CC BY-SA 4.0
PHT1 (9 генів)

Плазмалема епідермісу й волосків. PHT1;1 і PHT1;4 — головні: pht1;1 −30 %, pht1;1;pht1;4 −60–70 % поглинання.

PHT2

Внутрішня оболонка хлоропласта, H⁺/Pᵢ-симпорт.

PHT3 (3)

Внутрішня мембрана мітохондрій — Pᵢ для синтезу АТФ.

PHT4 (6)

Хлоропласти, нефотосинтезуючі пластиди, Гольджі (H⁺- або Na⁺-залежні).

PHT5 / VPT1 (3)

Тонопласт, SPX-домен: надлишок фосфату — у вакуолю.

PHO1

Гольджі/TGN клітин стели: завантаження Pᵢ у ксилему. Немає активності в дріжджах чи ооцитах — але це не доказ, що білок не транспортер: в рослині можуть бути потрібні кофактори.

П'ять рівнів регуляції PHT1

Інтерактивна модельХто вмикає і вимикає PHT1

Надлишок фосфату (і арсенату AsO₄³⁻, що проходить тими самими транспортерами) небезпечний, а транспорт дорогий — тому PHT1 контролюють від хроматину до виходу з ЕР.

9.4Помпи: AHA2, ACA, V-АТФаза

Активний транспорт усіх розглянутих іонів спирається на три родини АТФаз: P-типу (ковалентний фосфорильований інтермедіат), V-типу (роторні вакуолярні помпи) і F-типу (АТФ-синтази мітохондрій і хлоропластів).

H⁺-АТФаза плазмалеми AHA2

У рослин замість Na⁺/K⁺-АТФази головна помпа — H⁺-АТФаза підродини PIIIA (AHA1–AHA11, домінують AHA1 і AHA2), незворотно гальмується ортованадатом. Кристалічна структура AHA2 (Pedersen et al., 2007): мембранний домен M1–M10 (протон зв'язує Asp684, Asn106 — «заслінка» проти зворотного потоку), цитоплазматичні N (АТФ), P (фосфорилюється Asp329) і A (дефосфорилювання і «поршень»), і автоінгібіторний C-кінцевий R-домен.

Інтерактивна модельФосфо-код H⁺-АТФази AHA2

Увімкніть сигнали: яскраві сайти фосфорильовані. Активність визначає комбінація сайтів.

апопластцитозольM1–M10Asp684 (M6) · Asn106 (M2)H⁺ назовніA-доменP-доменAsp329~PN-доменMg-АТФR-доменT881S899S931T94714-3-3

СайтЕфектХто і коли
Thr947активація: сайт для 14-3-3, що знімає автоінгібуваннясинє світло (фототропіни → BLUS1 → BHP); ауксин (SAUR гальмують фосфатазу PP2C.D — «кислий ріст»); брасиностероїди, сахароза
Thr881активаціярецепторні кінази, напр. PSY1R на пептид PSY1
Ser899гальмування, залужнення апопластупептид RALF + рецептор FERONIA — зупиняє ріст (імунітет, запліднення)
Ser931гальмування: 14-3-3 не сідає навіть при P-Thr947кіназа PKS5 (CIPK11) при лужному стресі й високому Ca²⁺ (Fuglsang et al., 2007)

Ca²⁺-АТФази ACA

ACA (рослини)каталітичне ядроNCCaM-доменплазмалема, ЕР, тонопласт, пластидиPMCA (тварини)каталітичне ядроNCCaM-доменлише плазмалема
Рослинні ACA (підродина PIIB) працюють на всіх мембранах (ACA8, 9, 10 — плазмалема; ACA1, 2, 7 — ЕР; ACA4, 11 — тонопласт), а автоінгібіторний CaM-домен у них на N-кінці, тоді як у тваринних PMCA — на C-кінці.

Ca²⁺–CaM сідає на N-кінець ACA і знімає автоінгібування (CDPK додатково фосфорилюють Ser22). Саме швидкість вмикання й відкачування ACA задає гостроту і частоту кальцієвих піків. AtACA9 на плазмалемі пилкових трубок потрібна для верхівкових осциляцій Ca²⁺, росту трубки і запліднення (Schiøtt et al., 2004).

V-АТФаза

цитозольлюмен вакуоліV₁: (AB)₃ — гідроліз АТФD, F (вісь)статор aV₀: кільце c — роторH⁺
Ротор V-АТФази: гідроліз АТФ у гексамері (AB)₃ сектора V₁ обертає вісь D/F і кільце c сектора V₀ відносно статора a — H⁺ переходить у вакуолю чи TGN. Щонайменше 13 типів субодиниць.
Схема V-АТФази
Будова V-АТФази: каталітичний сектор V₁ і мембранний ротор V₀.Ribet ABP, Ng PY and Pavlos NJ · CC BY 4.0
Модель АТФ-синтази
АТФ-синтаза F-типу (модель за PDB).Wikimedia Commons · Public domain

Редокс-регуляція: H₂O₂, NO, малеїмід і окиснений глутатіон гальмують V-АТФазу (як і H⁺-АТФазу плазмалеми), окиснюючи чи нітрозилюючи цистеїни субодиниці A; відновники і H₂S повертають активність.

Покажчик білків і сигнальних модулів

Абетковий перелік: назва → що це → розділ конспекту.

14-3-3білки, що активують AHA2 після фосфорилювання Thr9479.4 · Помпи: AHA2, ACA, V-АТФазаABI1 / ABI2фосфатази PP2C — гальмо шляху АБК8.2 · SLAC1 і закривання продихівACA8 / 9Помпа (АТФаза) · Плазмалема9.4 · Помпи: AHA2, ACA, V-АТФазаAHA2Помпа (АТФаза) · Плазмалема9.4 · Помпи: AHA2, ACA, V-АТФазаAKT1 + AtKC1Канал · Плазмалема3.3 · П'ять груп каналів ShakerAKT2слабко випрямляючий канал флоеми, «калієва батарея»3.3 · П'ять груп каналів ShakerALMT1Канал · Плазмалема8.4 · Родина ALMTALMT12 (QUAC1)Канал · Плазмалема8.4 · Родина ALMTALMT9Канал · Тонопласт8.4 · Родина ALMTAtClC-aТранспортер · Тонопласт8.3 · Родина CLC і AtClC-aAtFH5формін везикул пилку7.3 · Семінар: проростання пилкуAtPIEZO1механорецепція кінчика кореня7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOCAXТранспортер · Тонопласт2.5 · Везикули RSO та ISOCBL1 / CBL9кальцієві сенсори для CIPK233.4 · Регуляція AKT1 комплексом CBL–CIPKCBL4 (SOS3) – CIPK6доставка AKT2 на плазмалему3.4 · Регуляція AKT1 комплексом CBL–CIPKCEP1 – CEPR1 – CEPD – CEPHсистемний пептидний сигнал азотного голодування9.2 · NRT2 і пептидний сигнал CEPCIPK23кіназа, що активує AKT1, HAK5, NRT1.1, SLAC13.4 · Регуляція AKT1 комплексом CBL–CIPKCNGC14 / 18Канал · Плазмалема6.3 · CNGC, сенсор YC3.6 і гравітропізмFERONIA / RALFрецептор і пептид, що гальмують AHA2 (Ser899)9.4 · Помпи: AHA2, ACA, V-АТФазаGLR3.3 / 3.6Канал · Плазмалема6.4 · Канали GLR: мох і пораненняGORKКанал · Плазмалема3.3 · П'ять груп каналів ShakerHAK5Транспортер · Плазмалема5.1 · Родина KT/HAK/KUPHKT1;1Транспортер · Плазмалема4.3 · Транспортери HKT: клас I і IIHT1кіназа — негативний регулятор закривання при низькому CO₂8.2 · SLAC1 і закривання продихівKAT1 / KAT2Канал · Плазмалема3.3 · П'ять груп каналів ShakerKCO3редукований TPK (2TM/1P)4.2 · Тандем-порові канали TPKKcsAбактеріальний K⁺-канал, модель селективного фільтра TVGYG1.5 · Селективний фільтр KcsAKEA1 / 2Транспортер · Оболонка хлоропласта5.2 · Хлоропластні антипортери KEAKEA3Транспортер · Тилакоїд5.2 · Хлоропластні антипортери KEAKUP5K⁺-транспортер з аденілатциклазою5.1 · Родина KT/HAK/KUPKUP9Транспортер · Мембрана ЕР5.1 · Родина KT/HAK/KUPMCA · OSCA · MSL · PIEZOКанал · Плазмалема7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOMCA1 / MCA2Ca²⁺-канали, що відчувають твердість субстрату7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOMSL1Канал · Мітохондрія7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOMSL10механочутливий канал із сигналом клітинної смерті7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOMSL2 / 3Канал · Оболонка хлоропласта7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOMSL8механочутливий канал пилку: модель гідратації8.5 · Семінар: модель гідратації пилкуNHXТранспортер · Тонопласт1.3 · Електрохімічний градієнт і рівняння НернстаNLA / miR827убіквітин-лігаза, ендоцитоз PHT19.3 · Фосфат і родина PHTNRT1.1Транспортер · Плазмалема9.1 · Нітрат і трансцептор NRT1.1NRT1.5 / 1.8 / 1.9завантаження й розвантаження ксилеми нітратом9.2 · NRT2 і пептидний сигнал CEPNRT2.1Транспортер · Плазмалема9.2 · NRT2 і пептидний сигнал CEPOSCA1 / OSCA1.3осмосенсор; імунне закривання продихів (BIK1, Ser54)7.2 · MSL, MCA, OSCA, PIEZOOsHKT2;1 / 2;2HKT класу II у рису4.3 · Транспортери HKT: клас I і IIOST1 (SnRK2.6)кіназа, що відкриває SLAC1 (Ser120)8.2 · SLAC1 і закривання продихівPHF1шаперон виходу PHT1 з ЕР9.3 · Фосфат і родина PHTPHO1завантаження фосфату в ксилему9.3 · Фосфат і родина PHTPHO2 / miR399посттранскрипційний контур фосфату9.3 · Фосфат і родина PHTPHR1 / SPX1головний регулятор фосфорного голодування9.3 · Фосфат і родина PHTPHT1;1 / 1;4Транспортер · Плазмалема9.3 · Фосфат і родина PHTPHT2Транспортер · Оболонка хлоропласта9.3 · Фосфат і родина PHTPHT3Транспортер · Мітохондрія9.3 · Фосфат і родина PHTPHT5 (VPT1)Транспортер · Тонопласт9.3 · Фосфат і родина PHTPKS5кіназа, що гальмує H⁺-АТФазу (Ser931)2.5 · Везикули RSO та ISOPLDα1 / PLDδфосфоліпази D, синтез фосфатидної кислоти5.4 · Семінар: фосфатидна кислота і SOS2PpGLR1 / 2GLR моху: хемотаксис сперматозоїдів6.4 · Канали GLR: мох і пораненняPYR/PYL/RCARрецептори АБК8.2 · SLAC1 і закривання продихівRBOHDНАДФН-оксидаза, апопластна хвиля АФК6.5 · TPC1 і системні хвиліSKORвихідний K⁺-канал стели: секреція K⁺ у ксилему3.3 · П'ять груп каналів ShakerSLAC1Канал · Плазмалема8.2 · SLAC1 і закривання продихівSLAH3гомолог SLAC1 у коренях8.2 · SLAC1 і закривання продихівSOS1Транспортер · Плазмалема5.4 · Семінар: фосфатидна кислота і SOS2SOS2 (CIPK24)кіназа, рекрутується фосфатидною кислотою через Lys575.4 · Семінар: фосфатидна кислота і SOS2SPIK (AKT6)вхідний K⁺-канал пилкових трубок3.3 · П'ять груп каналів ShakerTPC1 (SV)Канал · Тонопласт6.5 · TPC1 і системні хвиліTPK1Канал · Тонопласт4.2 · Тандем-порові канали TPKTPK3Канал · Тилакоїд4.2 · Тандем-порові канали TPKTRH1 (KUP4)ріст кореневих волосків, ефлюкс ауксину5.1 · Родина KT/HAK/KUPTsHKT1;2HKT галофіта з аспартатом у порі P_B4.4 · Галофіт Thellungiella: заміна N→DV-PPaseПомпа (АТФаза) · Тонопласт1.2 · Мембранний потенціал: рослини проти тваринV-АТФазаПомпа (АТФаза) · Тонопласт9.4 · Помпи: AHA2, ACA, V-АТФазаYC3.6FRET-сенсор Ca²⁺6.3 · CNGC, сенсор YC3.6 і гравітропізм

Контрольні питання

Чому чистий ліпідний бішар непроникний для іонів?
Іон оточений гідратною оболонкою; щоб увійти в гідрофобне ядро бішару, він мав би скинути воду — енергетичний бар'єр дегідратації нездоланний. Тому іони перетинають мембрану лише через білки: канали, транспортери, помпи.
Чим потенціал спокою рослинної клітини відрізняється від тваринної?
У рослин його створює H⁺-АТФаза P-типу (у тварин — Na⁺/K⁺-АТФаза), він значно негативніший (−120…−200 мВ проти −60…−90 мВ), а вторинний транспорт живиться протонно-рушійною силою, а не градієнтом Na⁺.
Обчисліть EK при [K⁺]in = 140 мМ і [K⁺]out = 4 мМ (21 °C).
EK = 61 · lg(4/140) ≈ −94 мВ.
Чому Erev не змінюється від активатора чи інгібітора каналу?
Потенціал реверсії визначається лише концентраціями іона по обидва боки, зарядом і температурою (рівняння Нернста). Активатор змінює провідність — нахил I–V кривої, — але не точку, де струм дорівнює нулю.
Чому K⁺-канал пропускає K⁺, але не менший Na⁺?
Карбонільні кисні мотиву TVGYG чотирьох субодиниць утворюють «клітку», що точно відповідає дегідратованому K⁺ і компенсує втрату води. Na⁺ замалий: він дістає лише 1–2 кисні, тож дегідратація не компенсується.
Назвіть чотири конфігурації patch clamp і для чого кожна зручна.
Cell-attached — поодинокі канали без порушення клітини; whole-cell — сумарний струм клітини; inside-out — дія цитоплазматичних лігандів (Ca²⁺, АТФ, кінази); outside-out — дія позаклітинних лігандів і блокаторів.
Навіщо для дослідження H⁺-АТФази потрібні везикули inside-out?
У ~80 % везикул (right-side-out) каталітичний домен усередині й недоступний для АТФ. Лише у вивернутих (ISO) везикулах АТФ із середовища запускає помпу, що закачує H⁺ усередину везикули.
Чому вхідні K⁺-канали рослин відкриваються гіперполяризацією?
При мікромолярному K⁺ у ґрунті пасивний вхід можливий лише при Vm негативнішому за EK. Канал, що відкривався б при деполяризації, випускав би K⁺ з клітини.
Як комплекс CBL1/9–CIPK23 активує AKT1?
Низький K⁺ викликає Ca²⁺-сигнал; Ca²⁺ зв'язується з CBL1/CBL9, які рекрутують і активують кіназу CIPK23; вона зв'язується з анкіриновим доменом AKT1 і фосфорилює Ser26 і Ser338.
Чому мутант hkt1 чутливіший до засолення, ніж дикий тип?
HKT1;1 у ксилемній паренхімі забирає Na⁺ із ксилемного соку назад у корінь. Без нього натрій із транспіраційним потоком іде в листки й руйнує хлоропласти.
Яку роль відіграють TPK3 і KEA3 у тилакоїдах?
TPK3 випускає K⁺ з люмена, розряджаючи ΔΨ і переводячи протонно-рушійну силу в ΔpH (синтез АТФ, NPQ). KEA3 при переході в тінь обмінює H⁺ люмена на K⁺, швидко знімаючи ΔpH і NPQ.
Що таке кальцієва сигнатура і чому важливе видалення Ca²⁺?
Унікальна для стимулу динаміка [Ca²⁺]cyt (амплітуда, тривалість, частота, локалізація), яку розшифровують CaM, CML, CDPK, CBL–CIPK. Чітку форму піків і осциляцій забезпечує швидке відкачування Ca²⁺ АТФазами ACA/ECA і антипортерами CAX.
Як працює FRET-сенсор Yellow Cameleon?
CFP і YFP з'єднані кальмодуліном і пептидом M13. Зв'язування Ca²⁺ стягує їх разом; при збудженні CFP енергія переходить на YFP, і відношення YFP/CFP (535/480 нм) зростає.
Як поширюється системна хвиля Ca²⁺ при засоленні кореня?
Естафетою: Ca²⁺ → RBOHD → H₂O₂ в апопласт → Ca²⁺-канали сусідньої клітини → TPC1 вивільняє Ca²⁺ з вакуолі й підсилює сигнал. Без TPC1 чи RBOHD хвиля повільна і згасає.
Як довели, що MCA1 відкривається натягом ліпідів?
Фрагмент MCA1, синтезований у безклітинній системі, вбудували в чисті ліпосоми без цитоскелета й стінки: Popen зростав пропорційно тиску в піпетці.
Які три гілки сигналів відкривають SLAC1?
Кальцій-незалежна АБК (PYR/PYL ⊣ ABI1 → OST1), кальцій-залежна (CPK6/21/23, CBL1/9–CIPK23) і CO₂/бікарбонат (βCA → RHC1 ⊣ HT1 → OST1).
Чим AtClC-a відрізняється від класичного хлоридного каналу?
Це антипортер 2NO₃⁻/1H⁺, а не канал: він запасає нітрат у вакуолі за рахунок протонного градієнта; АТФ гальмує його, АМФ знімає гальмування.
Чому NRT1.1 називають трансцептором?
Він не лише переносить нітрат (з дуальною афінністю, перемикач — Thr101), а й сигналізує про нього: мутант chl1-9 без транспорту зберігає індукцію NRT2.1. До того ж NRT1.1 переносить ауксин і керує ростом бічних коренів.
Назвіть п'ять рівнів регуляції PHT1.
Хроматин (H2A.Z, ARP6/IPK1), транскрипція (WRKY42/45, WRKY6, PHR1/SPX1), посттранскрипційний (miR399 ⊣ PHO2, miR827 ⊣ NLA), посттрансляційний вихід з ЕР (PHF1, CK2) і деградація/ендоцитоз.
Як ауксин активує H⁺-АТФазу AHA2?
Ауксин індукує білки SAUR, які гальмують фосфатазу PP2C.D; Thr947 залишається фосфорильованим, 14-3-3 знімає автоінгібування R-домену, апопласт закислюється — «кислий ріст».

Джерела

  1. Doyle D. A. et al. (1998). The structure of the potassium channel: molecular basis of K⁺ conduction and selectivity. Science, 280(5360), 69–77. PubMed
  2. Hedrich R., Neher E. (1987). Cytoplasmic calcium regulates voltage-dependent ion channels in plant vacuoles. Nature, 329, 833–836. Nature
  3. Larsson C., Sommarin M., Widell S. (1994). Isolation of highly purified plant plasma membranes and separation of inside-out and right-side-out vesicles. Methods in Enzymology, 228, 451–469. ScienceDirect
  4. Fuglsang A. T. et al. (2007). Arabidopsis protein kinase PKS5 inhibits the plasma membrane H⁺-ATPase by preventing interaction with 14-3-3 protein. The Plant Cell, 19(5), 1617–1634. PubMed
  5. Xu J. et al. (2006). A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K⁺ transporter AKT1 in Arabidopsis. Cell, 125(7), 1347–1360. PubMed
  6. Li L. et al. (2006). A Ca²⁺ signaling pathway regulates a K⁺ channel for low-K response in Arabidopsis. PNAS, 103(33), 12625–12630. PNAS
  7. Held K. et al. (2011). Calcium-dependent modulation and plasma membrane targeting of the AKT2 potassium channel by the CBL4/CIPK6 calcium sensor/protein kinase complex. Cell Research / PNAS. PNAS
  8. Xia J. et al. (2014). Nitric oxide negatively regulates AKT1-mediated potassium uptake through modulating vitamin B6 homeostasis in Arabidopsis. PNAS, 111(45), 16196–16201. PubMed
  9. Gobert A. et al. (2007). The two-pore channel TPK1 gene encodes the vacuolar K⁺ conductance and plays a role in K⁺ homeostasis. PNAS, 104(25), 10726–10731. PMC
  10. Carraretto L. et al. (2013). A thylakoid-located two-pore K⁺ channel controls photosynthetic light utilization in plants. Science, 342(6154), 114–118. Science
  11. Berthomieu P. et al. (2003). Functional analysis of AtHKT1 in Arabidopsis shows that Na⁺ recirculation by phloem is crucial for salt tolerance. The EMBO Journal, 22(9), 2004–2014. PMC
  12. Horie T. et al. (2001). Two types of HKT transporters with different properties of Na⁺ and K⁺ transport in Oryza sativa. The Plant Journal, 27(2), 129–138. PMC
  13. Ali Z. et al. (2012). TsHKT1;2, a HKT1 homolog from the extremophile Arabidopsis relative Thellungiella salsuginea, shows K⁺ specificity in the presence of NaCl. Plant Physiology, 158(3), 1463–1474. PMC
  14. Ali A. et al. (2016). A single amino-acid substitution in the sodium transporter HKT1 associated with plant salt tolerance. Plant Physiology, 171(3), 2112–2126. PMC
  15. Ragel P. et al. (2015). The CBL-interacting protein kinase CIPK23 regulates HAK5-mediated high-affinity K⁺ uptake in Arabidopsis roots. Plant Physiology, 169(4), 2863–2873. PMC
  16. Rigas S. et al. (2001). TRH1 encodes a potassium transporter required for tip growth in Arabidopsis root hairs. The Plant Cell, 13(1), 139–151. PMC
  17. Vicente-Agullo F. et al. (2004). Potassium carrier TRH1 is required for auxin transport in Arabidopsis roots. The Plant Journal, 40(4), 523–535. PubMed
  18. Zhang M. L. et al. (2020). KUP9 maintains root meristem activity by regulating K⁺ and auxin homeostasis in response to low K. EMBO Reports, 21(6), e50164. PubMed
  19. Al-Younis I. et al. (2018). The Arabidopsis thaliana K⁺-uptake permease 5 (AtKUP5) contains a functional cytosolic adenylate cyclase essential for K⁺ transport. Frontiers in Plant Science, 9, 1645. PMC
  20. Kunz H. H. et al. (2014). Plastidial transporters KEA1, -2, and -3 are essential for chloroplast osmoregulation, integrity, and pH regulation in Arabidopsis. PNAS, 111(20), 7480–7485. PMC
  21. Li J. et al. (2023). Phosphatidic acid–regulated SOS2 controls sodium and potassium homeostasis in Arabidopsis under salt stress. The EMBO Journal, 42(8), e112401. PMC
  22. Shih H. W. et al. (2015). The cyclic nucleotide-gated channel CNGC14 regulates root gravitropism in Arabidopsis thaliana. Current Biology, 25(23), 3119–3125. PMC
  23. Ortiz-Ramírez C. et al. (2017). GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE channels are essential for chemotaxis and reproduction in mosses. Nature, 549(7670), 91–95. PubMed
  24. Toyota M. et al. (2018). Glutamate triggers long-distance, calcium-based plant defense signaling. Science, 361(6407), 1112–1115. PubMed
  25. Peiter E. et al. (2005). The vacuolar Ca²⁺-activated channel TPC1 regulates germination and stomatal movement. Nature, 434(7031), 404–408. PubMed
  26. Choi W. G. et al. (2014). Salt stress-induced Ca²⁺ waves are associated with rapid, long-distance root-to-shoot signaling in plants. PNAS, 111(17), 6497–6502. PubMed
  27. Hamant O. et al. (2008). Developmental patterning by mechanical signals in Arabidopsis. Science, 322(5908), 1650–1655. Science
  28. Veley K. M. et al. (2014). Arabidopsis MSL10 has a regulated cell death signaling activity that is separable from its mechanosensitive ion channel activity. The Plant Cell, 26(7), 3115–3131. PMC
  29. Nakagawa Y. et al. (2007). Arabidopsis plasma membrane protein crucial for Ca²⁺ influx and touch sensing in roots. PNAS, 104(9), 3639–3644. PMC
  30. Nakano M. et al. (2011). Membrane tension induces stretch-activated Ca²⁺ channel activity in Arabidopsis MCA1 synthesized in cell-free system. PLOS ONE / Journal of Biological Chemistry. PMC
  31. Yuan F. et al. (2014). OSCA1 mediates osmotic-stress-evoked Ca²⁺ increases vital for osmosensing in Arabidopsis. Nature, 514(7522), 367–371. PubMed
  32. Thor K. et al. (2020). The calcium-permeable channel OSCA1.3 regulates plant stomatal immunity. Nature, 585(7826), 569–573. PMC
  33. Mousavi S. A. R. et al. (2021). PIEZO ion channel is required for root mechanotransduction in Arabidopsis thaliana. PNAS, 118(20), e2102188118. PubMed
  34. Ruan H. et al. (2023). Periodic delivery of AtFH5-decorated vesicles carrying CNGC18 drives oscillatory Ca²⁺ and stepwise exocytosis during pollen germination. (Cited in review on transmembrane formins in membrane trafficking). Journal of Experimental Botany
  35. Schroeder J. I., Hagiwara S. (1989). Cytosolic calcium regulates ion channels in the plasma membrane of Vicia faba guard cells. Nature, 338, 427–430. Nature
  36. Linder B., Raschke K. (1992). A slow anion channel in guard cells, activating at large hyperpolarization, may be principal for stomatal closing. FEBS Letters, 313(1), 27–30. ScienceDirect
  37. Vahisalu T. et al. (2008). SLAC1 is required for plant guard cell S-type anion channel function in stomatal signalling. Nature, 452(7186), 487–491. PubMed
  38. Negi J. et al. (2008). CO₂ regulator SLAC1 and its homologues are essential for anion homeostasis in plant cells. Nature, 452(7186), 483–486. PubMed
  39. Chen Y. H. et al. (2010). Homologue structure of the SLAC1 anion channel for closing stomata in leaves. Nature, 467(7319), 1074–1080. PMC
  40. De Angeli A. et al. (2006). The nitrate/proton antiporter AtCLCa mediates nitrate accumulation in plant vacuoles. Nature, 442(7105), 939–942. ResearchGate
  41. De Angeli A. et al. (2009). ATP binding to the C terminus of the Arabidopsis thaliana nitrate/proton antiporter, AtCLCa, regulates nitrate transport into plant vacuoles. The Plant Cell, 21(1), 170–184. PMC
  42. Wege S. et al. (2014). Phosphorylation of the vacuolar anion exchanger AtCLCa is required for the stomatal response to abscisic acid. Science Signaling, 7(333), ra65. PMC
  43. Sasaki T. et al. (2004). A wheat gene encoding an aluminum-activated malate transporter. The Plant Journal, 37(5), 645–653. PubMed
  44. Meyer S. et al. (2010). AtALMT12 represents an R-type anion channel required for stomatal movement in Arabidopsis guard cells. The Plant Journal, 63(6), 1054–1062. PMC
  45. Baird M. A. et al. (2022). In vitro experiments and kinetic models of Arabidopsis pollen hydration mechanics show that MSL8 is not a simple tension-gated osmoregulator. Current Biology, 32(13), 2921–2934. PubMed
  46. Tsay Y. F. et al. (1993). The herbicide sensitivity gene CHL1 of Arabidopsis encodes a nitrate-inducible nitrate transporter. Cell, 72(5), 705–713. PubMed
  47. Liu K. H., Huang C. Y., Tsay Y. F. (1999). CHL1 is a dual-affinity nitrate transporter of Arabidopsis involved in multiple phases of nitrate uptake. The Plant Cell, 11(5), 865–874. PMC
  48. Ho C. H. et al. (2009). CHL1 functions as a nitrate sensor in plants. Cell, 138(6), 1184–1194. Plant Cell Reference
  49. Krouk G. et al. (2010). Nitrate-regulated auxin transport by NRT1.1 defines a mechanism for nutrient sensing in plants. Developmental Cell, 18(6), 927–937. PubMed
  50. Ohkubo Y. et al. (2017). Shoot-to-root mobile polypeptides involved in systemic regulation of nitrogen acquisition. Nature Plants, 3, 17029. PubMed
  51. Ohkubo Y. et al. (2021). Type 2C protein phosphatase-mediated dephosphorylation of NRT2.1 activates high-affinity nitrate uptake in roots. Nature Plants, 7(7), 903–910. PMC
  52. Muchhal U. S., Pardo J. M., Raghothama K. G. (1996). Phosphate transporters from the higher plant Arabidopsis thaliana. PNAS, 93(19), 10519–10523. PMC
  53. Pedersen B. P. et al. (2007). Crystal structure of the plasma membrane proton pump. Nature, 450(7172), 1111–1114. PMC
  54. Schiøtt M. et al. (2004). A plant plasma membrane Ca²⁺ pump is required for normal pollen tube growth and fertilization. PNAS, 101(25), 9502–9507. PMC