Лабораторна робота № 3

Кислотно-основні властивості амінокислот

Як за кривою титрування визначити pKa іоногенних груп, ізоелектричну точку та впізнати амінокислоту.

БіохіміяАмінокислоти≈ 90 хвилин

01Мета і план

Мета

Вивчити амфотерні властивості амінокислот, навчитися визначати за кривою титрування значення pKa іоногенних груп та ізоелектричну точку (pI) і за ними ідентифікувати амінокислоту.

Ви навчитеся

  • читати криву титрування і знаходити точки напівнейтралізації;
  • розраховувати pI для нейтральних, кислих і основних амінокислот;
  • пояснювати буферні властивості амінокислот і білків.

Знадобиться

Калькулятор або Excel, бланк звіту, міліметровий папір для побудови кривої титрування.

02Теоретичні відомості

Амінокислоти — амфотерні сполуки

Кожна α-амінокислота містить щонайменше дві іоногенні групи: карбоксильну (–COOH, слабка кислота) та аміногрупу (–NH3+, кислота, спряжена зі слабкою основою). У розчині за фізіологічних pH амінокислота існує переважно у формі цвітер-іона +H3N–CHR–COO−. Під час титрування лугом протони відщеплюються послідовно — спершу від карбоксильної групи, потім від аміногрупи:

H3N+–CHR–COOH⇌pK1H3N+–CHR–COO−⇌pK2H2N–CHR–COO− (1)

Рівняння Гендерсона–Гассельбаха

Співвідношення депротонованої (A−) і протонованої (HA) форм кожної групи визначає pH розчину:

pH=pKa+lg[A−][HA] (2)

Коли половину групи нейтралізовано ([A−] = [HA]), pH = pKa. Тому на кривій титрування значення pKa відповідають точкам напівнейтралізації — 0,5; 1,5; 2,5 еквівалента лугу. Поблизу цих точок крива найпологіша: тут розчин має найбільшу буферну ємність (±1 одиниця pH навколо pKa).

Частку дисоційованої форми групи з константою Ka описує вираз, з якого будується вся крива титрування:

α=11+10pKa−pH,n(pH)=∑iαi (3)

n — середня кількість відщеплених протонів на молекулу; саме її ми відкладаємо по осі абсцис як кількість еквівалентів доданого лугу.

Ізоелектрична точка

Ізоелектрична точка (pI) — значення pH, за якого сумарний заряд молекули дорівнює нулю. В електричному полі амінокислота в pI не рухається, а розчинність білків у pI мінімальна (на цьому ґрунтується ізоелектричне осадження). pI дорівнює середньому арифметичному двох pKa, що «оточують» нейтральну форму:

pI=pK1+pK22(нейтральні);pI=pK1+pKR2(кислі);pI=pKR+pK22(основні) (4)

Кислі амінокислоти (аспарагінова, глутамінова) мають додаткову карбоксильну групу в радикалі й pI ≈ 3; основні (лізин, аргінін, гістидин) — додаткову аміногрупу або гуанідинову/імідазольну групу й pI ≈ 7,6–10,8. Кількість ступенів на кривій титрування дорівнює кількості іоногенних груп.

Значення для рослинної клітини

Іоногенні групи амінокислотних залишків визначають заряд і конформацію білків, а отже — роботу ферментів (див. ЛР 2: pH-оптимум). Вільні амінокислоти та білки цитоплазми є буферною системою, що разом із фосфатною підтримує pH цитозолю ≈ 7,2–7,5. Гістидин (pKR ≈ 6,0) — найкращий буфер у фізіологічному діапазоні, а його імідазольна група часто бере участь у кислотно-основному каталізі.

03Інтерактивна модель

Оберіть амінокислоту або задайте власні pKa. Ліворуч — крива титрування лугом (pH від кількості еквівалентів NaOH), праворуч — сумарний заряд молекули залежно від pH.

Амінокислота

Для «нейтральних» амінокислот третя група відсутня. Значення pKa — довідкові, для 25 °C.

Крива титрування

Сумарний заряд від pH

Ізоелектрична точка pI
—
Заряд при pH 7,4
—
Іоногенних груп
—
Буферні зони (pK ± 1)
—

04Віртуальний експеримент

Вам видано 20 мл 0,05 М розчину невідомої амінокислоти у формі гідрохлориду (усі групи протоновані). Розчин титрують 0,1 М NaOH, вимірюючи pH після кожної порції лугу. Побудуйте криву титрування, визначте pKa, pI та встановіть, яка це амінокислота.

Ваш варіант

Прізвище або номер у журналі.

05Завдання для звіту

  1. У моделі порівняйте криві титрування гліцину, глутамінової кислоти та лізину. Скільки ступенів має кожна крива і чому?
  2. Для гістидину визначте за моделлю заряд при pH 5, 7,4 і 9. Поясніть, чому гістидин — важливий буфер у клітині.
  3. За даними експерименту побудуйте криву титрування: pH від об'єму NaOH (мл) і від кількості еквівалентів (1 еквівалент = 10 мл 0,1 М NaOH на 1 ммоль амінокислоти).
  4. Знайдіть точки напівнейтралізації (0,5; 1,5; 2,5 екв.) і визначте за ними pKa. Для уточнення можна побудувати похідну ΔpH/ΔV: pK відповідають її мінімумам, точки еквівалентності — максимумам. Зверніть увагу: для дуже кислої групи (pKa < 3) значна частина доданого лугу витрачається на нейтралізацію вільних іонів H+, тому pH у точці напівнейтралізації вищий за pKa на 0,1–0,3.
  5. Розрахуйте pI за формулою (4), визначте амінокислоту за довідковими pKa і запишіть рівняння дисоціації її груп.

06Контрольні питання

Чому амінокислоти називають амфотерними сполуками?
Вони містять кислотні (–COOH) та основні (–NH2) групи, тому можуть як віддавати, так і приєднувати протони, реагуючи і з кислотами, і з лугами.
Що таке цвітер-іон?
Біполярний іон +H3N–CHR–COO−, що має одночасно позитивний і негативний заряди; у ньому амінокислота переважно перебуває в нейтральних розчинах.
Як визначити pKa за кривою титрування?
pKa дорівнює pH у точці напівнейтралізації відповідної групи (0,5; 1,5; 2,5 еквівалента лугу), де концентрації протонованої і депротонованої форм рівні.
Чому білки найгірше розчиняються в ізоелектричній точці?
У pI сумарний заряд молекул дорівнює нулю, електростатичне відштовхування між ними зникає, і молекули легше агрегують та випадають в осад.
Яка амінокислота є найкращим буфером при pH 7? Чому?
Гістидин: pKa імідазольної групи ≈ 6,0, тож поблизу нейтральних pH у розчині є помітні кількості обох форм цієї групи.

07Література

  1. Nelson D. L., Cox M. M. Lehninger Principles of Biochemistry. 8th ed. New York : W. H. Freeman, 2021. Ch. 3.
  2. Berg J. M., Tymoczko J. L., Gatto G. J., Stryer L. Biochemistry. 9th ed. New York : W. H. Freeman, 2019. Ch. 2.
  3. Губський Ю. І. Біологічна хімія : підручник. 2-ге вид. Вінниця : Нова Книга, 2009.
  4. Buchanan B. B., Gruissem W., Jones R. L. Biochemistry and Molecular Biology of Plants. 2nd ed. Wiley-Blackwell, 2015. Ch. 7.